 |
otevřeno pro veřejnost
čtvrtek 9:00 - 17:00
|
| |
|
 |
 |
| |
|
 |
|
Ústav komplexních systémů
|
| |
 Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Fakulta rybářství a ochrany vod
Ústav komplexních systémů
Zámek 136
373 33 Nové Hrady |
| ředitel ústavu |
Ing. Petr Císař, Ph.D. |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3802 |
+420 724 219 003 |
| asistentka ředitele |
Ing. Markéta Heroutová |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3802 |
+420 777 729 585 |
| |
|
|
|
|
| projektový manažer |
Mgr. Naděžda Štysová |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3810 |
+420 775 029 597 |
| projektový manažer |
Mgr. Michal Jarolímek |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3807 |
+420 776 296 285 |
| projektový manažer |
Olga Černá |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3807 |
+420 775 029 600 |
| |
|
|
|
|
| IT pracovník |
Michal Macho, DiS. |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3807 |
|
| uklízečka |
Miroslava Krtková |
|
|
|
| |
|
|
|
|
| Laboratoř Aplikované systémové biologie |
Personální obsazení a kontakty
| Prof. RNDr. Dalibor Štys, CSc. |
vedoucí laboratoře
|
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3842 |
| +420 777 729 581 |
|
|
zástupce vedoucího
|
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3802
|
| +420 724 219 003 |
|
|
vědecký pracovník
|
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3828
|
|
|
postdoktorandský pracovník
|
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3828
|
|
|
postdoktorandský pracovník
|
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3842
|
|
|
postdoktorandský pracovník
|
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3828
|
| Mgr. Jindřich Soukup |
odborný pracovník |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3808 |
| Mgr. Tomáš Náhlík |
doktorand |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3808 |
| Ing. Aliaxander Pautsina |
doktorand |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3808 |
| Karina Romanova |
doktorand |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3808 |
| Anna Zhyrova |
doktorand |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3808 |
| Daria Malakhova |
doktorand |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3808 |
| Vladimír Kotal |
technik |
Tato emailová adresa je chráněna před spamboty, abyste ji viděli, povolte JavaScript
|
+420 38 777 3808 |
 Laboratoř se zabývá základním a aplikovaným výzkumem komplexních systémů především v oblasti přírodních systémů. Základním směrem výzkumu je analýza chování přírodních systémů založená na automatickém zpracování dat z řízených experimentů. Laboratoř je funkčně propojena s ostatními laboratořemi Ústavu komplexních systémů, pro které zajišťuje analýzu dat a softwarové nástroje pro jejich vyhodnocování.
Klíčové aktivity:
• řízený experiment
• základní výzkum v oblasti světelné mikroskopie
• filtrace experimentálních dat
• strojové zpracování obrazu
• analýza mnohorozměrných dat
• systémy pro sledování pohybujících se objektů
• matematické modelování procesů
 Projekty: Automatické rozpoznávání chování buněčné kultury: Vyhodnocování stavu a vývoje buněčných kultur patři k běžně používaným metodám v oblasti bio-kompatibility materiálů či personalizované medicíny. Veškeré vyhodnocování chování probíhá ručně vyškolenými specialisty. Objemy dat, které je nutné vyhodnotit jsou obrovské a proto je prováděno pouze základní vyhodnocení mikroskopických experimentů. Množství informace o stavu buněčné kultury obsažené v experimentech je však mnohonásobně vyšší než jaké je člověk schopen analyzovat. Základním cílem projektu je proto vytvoření automatických metod pro detekování objektů v obrázcích z časo-sběrné mikroskopie a klasifikace chování těchto objektů. Výsledkem projektu by měla být automatizovaná metoda pro hodnocení stavu buněčných kultur v uživatelem definovaných podmínkách.
 Výzkum zobrazování mikroskopu: projekt je zaměřen na základní výzkum zobrazovacích technik světelné mikroskopie a to především Point spread function (PSF). Objekty zobrazované světelným mikroskopem jsou zatíženy zkreslením, které znesnadňuje využití automatických metod pro analýzu mikroskopických obrazů. Výzkum se zabývá přesným definováním pojmů jako rozlišitelnost, odlišitelnost, zaostření a možností využití PSF pro další analýzu mikroskopických dat.
 Embrioskop: projekt se zabývá vývojem jednoúčelového mikroskopu a softwarových nástrojů pro analýzu vývoje lidského embrya. Cílem projektu je vytvoření zařízení pro automatické vyhodnocování kvality embrya pomocí kombinace specializovaného mikroskopu a software pro zpracování obrazu.
|
|
Laboratoř se zabývá základním a aplikovaným výzkumem komplexních systémů především v oblasti přírodních systémů. Základním směrem výzkumu je analýza chování přírodních systémů založená na automatickém zpracování dat z řízených experimentů. Laboratoř je funkčně propojena s ostatními laboratořemi Ústavu komplexních systémů, pro které zajišťuje analýzu dat a softwarové nástroje pro jejich vyhodnocování.
Projekty: Automatické rozpoznávání chování buněčné kultury: Vyhodnocování stavu a vývoje buněčných kultur patři k běžně používaným metodám v oblasti bio-kompatibility materiálů či personalizované medicíny. Veškeré vyhodnocování chování probíhá ručně vyškolenými specialisty. Objemy dat, které je nutné vyhodnotit jsou obrovské a proto je prováděno pouze základní vyhodnocení mikroskopických experimentů. Množství informace o stavu buněčné kultury obsažené v experimentech je však mnohonásobně vyšší než jaké je člověk schopen analyzovat. Základním cílem projektu je proto vytvoření automatických metod pro detekování objektů v obrázcích z časo-sběrné mikroskopie a klasifikace chování těchto objektů. Výsledkem projektu by měla být automatizovaná metoda pro hodnocení stavu buněčných kultur v uživatelem definovaných podmínkách. 
Výzkum zobrazování mikroskopu: projekt je zaměřen na základní výzkum zobrazovacích technik světelné mikroskopie a to především Point spread function (PSF). Objekty zobrazované světelným mikroskopem jsou zatíženy zkreslením, které znesnadňuje využití automatických metod pro analýzu mikroskopických obrazů. Výzkum se zabývá přesným definováním pojmů jako rozlišitelnost, odlišitelnost, zaostření a možností využití PSF pro další analýzu mikroskopických dat.
Embrioskop: projekt se zabývá vývojem jednoúčelového mikroskopu a softwarových nástrojů pro analýzu vývoje lidského embrya. Cílem projektu je vytvoření zařízení pro automatické vyhodnocování kvality embrya pomocí kombinace specializovaného mikroskopu a software pro zpracování obrazu. 