29-30. 6. 2023 jsme v rámci přípravy realizace projektu TNA (AQUAEXCEL3.0) zaměřeného na automatickou detekci symptomů nemocí ryb pomocí kamer navštívili pracoviště DTU (Dánsko), které se specializuje na nemoci ryb (pstruh duhový). V laboratoři byl vyzkoušen systém pro nahrání video záznamů v nádržích a diskutovány technické možnosti umístění počítačů a přenosu dat. Samotný projekt bude realizován na podzim 2023.
Výzkumný tým z Laboratoře kontrolované reprodukce a intenzivního chovu ryb (LRICH) se zúčastnil konference AQUA2024, která se konala v Kodani, Dánsko, ve dnech 26. až 30. srpna 2024. Tým na konferenci představil jak ústní, tak posterové prezentace. Podrobnosti o prezentacích jsou následující:
Mahyar Zare: eposter: Vliv fermentovaného česneku Allium sativum na růstový výkon, biochemii krve, hematologii a imunitní systém juvenilních pstruhů duhových (Oncorhynchus mykiss).
Ghasem Rashidian: ústní prezentace: Synergické účinky čtyř druhů semen léčivých rostlin a chelatovaných minerálů na růst, imunitu a antioxidační kapacitu pstruha duhového.
Hung Quang Tran: ústní prezentace: Využití počítačového vidění k hodnocení chutnosti diety: případ pstruha duhového (Oncorhynchus mykiss) krmeného dietou s hmyzím proteinem.
Vlastimil Stejskal: eposter: Protein z metan-utilizujících bakterií (Methylococcus capsulatus) jako náhrada rybí moučky v dietě pro jesetera sibiřského (Acipenser baerii).
Ve dnech 8. – 11. září 2024 jsem se zúčastnila 58. kongresu evropských toxikologických společností (EUROTOX 2024) v dánské Kodani. Prezentovala jsem výsledky svého probíhajícího výzkumu prostřednictvím posterové prezentace. Můj prezentovaný výzkum byl zaměřen na sledování in vitro biologických aktivit některých environmentálně významných látek. Součástí cesty byly také diskuse o současné a budoucí spolupráci s výzkumníky z jiných institucí. Děkuji Grantové agentuře ČR (projekt č. 20-04676X), grantové agentuře Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích (projekt č. GAJU 006/2024/Z Amankwah) a udělenému projektu CENAKVA (LM2023038). Ministerstvem školství, mládeže a tělovýchovy ČR za záštitu výzkumu a cesty.
Ve dnech 25. až 30. srpna 2024 navštívili Václav Nebeský a Martin Prchal konferenci a trade show Aqua 2024, která se konala v dánské Kodani. Václav Nebeský po dobu 3 dní reprezentoval fakultu na veletržním stánku na trade show. Kolega Martin Prchal pak měl ústní prezentaci s názvem: The potential of selective breeding to eliminate unfavourable scaly patterns in Amur mirror carp. Tato prezentace představila možnosti selekčního šlechtění u Amurského lysce za účelem zlepšení nežádoucího ošupení tohoto plemene bez dalšího negativního vlivu na užitkové znaky.
Autoři: Václav Nebeský, Martin Prchal
Dr. Koushik Roy, zástupce vedoucího laboratoře výživy, se zúčastnil konference AQUA2024, která byla společně organizována Světovou společností pro akvakulturu a Evropskou společností pro akvakulturu ve dnech 26.–30. srpna 2024 v Kodani, Dánsko. Předsedal zde sekci „Ekosystémy“. Na konferenci přednesl dvě ústní prezentace, včetně speciálního workshopového vystoupení organizovaného EUROFISH Denmark na téma „Světlo a další organismy“, kde prezentoval výsledky národního projektu (QK22010177) zaměřeného na výživu rybníků v Evropě. Abstrakt naleznete zde: https://eurofish.dk/PDF/Light-abstracts/10.pdf. Společně s prof. Marcem Verdegemem z Wageningenské univerzity vedl Koushik plodné diskuse o vytvoření budoucích konsorcií v rámci programu H2020, návrhu speciálního čísla o výživě v rybnících a vypracování odborného stanoviska o roli rybníků v akvakultuře a potravinových systémech. Mezi předními odborníky v oblasti výživy v akvakultuře nebo rybníkové akvakultury byli zejména prof. Giovanni M. Turchini (Univerzita v Melbourne) a prof. Delbert Gatlin III (Texaská A&M univerzita). Tyto aktivity tak globálně rozšiřují mandáty výzkumného programu CENAKVA 3.
Ve dnech 26. až 29. srpna 2024 cestovali Jan Urban a Mohammad Mehdi Ziaei z Laboratoře zpracování signálu a obrazu do dánské Kodaně, aby se zúčastnili konference Aqua 2024, která se konala v Bella Center. Tato událost je významným setkáním pro profesionály v oblasti akvakultury a nabízí platformu pro seznámení se s nejnovějším výzkumem a pro spolupráci s odborníky v oboru.
Ústní prezentace:
Jan Urban: Prezentace na téma „RYBÍ AKUSTICKÁ TELEMETRIE: PŘÍČINNÝ STOCHASTICKÝ SYSTÉM A ANALÝZA MARKOVSKÉHO MODELU“
Mohammad Mehdi Ziaei: Prezentace na téma „TECHNOLOGIE KAMERY PRO VČASNÉ FÁZE DETEKCE A PŘEDPOVĚDI SYNDROMU ČERVENÉ ZNÁMKY U Pstruha duhového Oncorhynchus mykiss“
Mohammad Mehdi Ziaei: Prezentace na téma „PŘIZPŮSOBENÍ INDIVIDUÁLNÍ IDENTIFIKACE ZALOŽENÉ NA CNN K IDENTIFIKACI RYB JEDNOTLIVCŮ ZA SKUTEČNÝCH PODMÍNEK“
Tato cesta byla vysoce produktivní a poskytla hlubší pochopení současných trendů a inovací v akvakultuře. Nabízela také příležitost k propojení s výzkumnými pracovníky a odborníky z oboru, což by mohlo vést k budoucí spolupráci. Poznatky získané během konference by mohly být pro naši laboratoř velmi přínosné.
Autor: Mohammad Mehdi Ziaei
Doc. Borys Dzyuba a doktorand Anatolij Sotnikov se zúčastnili mezinárodní konference CRYO 2022, pořádané Společností pro kryobiologii a Společností pro nízkoteplotní biologii, konané 19. – 22. července 2022 v irském Dublinu. Přednesli tři prezentace (doc. Dzyuba jako pozvaný řečník, A. Sotnikov jako řečník). Prezentace se týkaly subpopulací spermií v kryokonzervovaném rybím spermatu po jeho rozmrazení, nových metod kryokonzervace kapřího spermatu a mezinárodní spolupráce v kryobankingu rybích spermií. Po konferenci následovalo setkání se zástupci laboratoří Rutherford Appleton (ISIS Facility, STFC, Rutherford Appleton Laboratory (UK)) a společnosti Health Economics and Outcomes Research Ltd (UK). Byly diskutovány možnosti aplikace metod využívajících rozptylu neutronového paprsku (neutron scattering) ke studiu tvorby krystalů ledu během kryokonzervace a statistické metody analýzy dat pro vícerozměrné hodnocení subpopulace spermií, které se objevily po kryokonzervaci u ryb. Na závěr setkání byl nastíněn možný budoucí společný projekt s ISIS. Cesta se uskutečnila v rámci realizace projektu GAČR N 22-14069S.
Dne 28.02-30.04.2022 podnikla MSc. Tatyana Gebauer, Ph.D. služební cestu do Institutu pro biologii chovných zvířat (FBN). Cílem jejího pobytu bylo získat a zpracovat data z profilů genové exprese imunitních odpovědí mezi sedmi různými populacemi okouna obecného, Perca fluviatilis, proti Aeromonas spp. Výsledky této práce budou prezentovány na 5. mezinárodním sympoziu okounovitých ryb.
Tuto služební cestu finančně podpořil Erasmus+ program.
Ve dnech 11.-15. 9. 2023 provedli pracovníci FROV JU (Bořek Drozd, Jan Kubec, Lukáš Veselý, Martin Vlk, Martin Bláha, Marek Let, Daniel Kvapil, Filip Kupka, Das Koushik, Iqbal Azeem, Oficialdegui Aladren Francisco Javier a Balzani Paride) spolu s kolegy ze Slovenského rybářského svazu monitoring rybích obsádek slovenské části řeky Dunaj a její ramenné soustavy v rámci integrovaného projektu LIFE Living Rivers (101069837/LIFE21-IPE-SK-Living Rivers). Výsledky průzkumů budou sloužit k zhodnocení současného stavu rybích obsádek, nastavení udržitelného rybářského managementu a jsou také klíčové pro projektování rybích přechodů, kterými se zprůchodní gigantická vodní díla Gabčíkovo a Čunovo.
RNDr. Bořek Drozd, Ph.D.
Ve dnech 11.-12.5.2023 provedli pracovníci FROV JU (Dr. Bořek Drozd a Ing. M. Šindler) spolu s kolegy ze Slovenského rybářského sväzu a Bodenkultur Universität (Vídeň, Rakousko) odlovy jeseterů malých na Dunaji. Dále proběhlo vytipování vhodných lokalit pro ichtyomonitoring v rámci projektu LIFE21-IPE-SK-LIFE Living Rivers/101069837.
Autor: RNDr. Bořek Drozd, Ph.D.
Ve dnech 20.-25.03.2023 provedli pracovníci FROV JU (Dr. Bořek Drozd a Ing. M. Šindler) spolu s kolegy z Hydrobiologického ústavu BC AVČR v.v.i. přípravné testy v terénu pro ověření funkčnosti technologie a její nastavení pro telemetrickou studii migrační prostupnosti klíčových bariér a vodních staveb ve slovenské části Dunaje (Čunovo, Gabčíkovo, Dunakiliti a další) pro ryby. Akce byla provedena v souladu s cíli WP6 projektu LIFE21-IPE-SK-LIFE Living Rivers/101069837.
RNDr. Bořek Drozd, Ph.D.
Dne 14. 6. 2023 provedli pracovníci FROV JU (Bořek Drozd, Miloš Buřič, Jan Kubec, Martin Vlk a M. Šindler) spolu s ostatními partnerskými organizacemi projektu LIFE Living Rivers (LIFE21-IPE-SK-LIFE Living Rivers/101069837) vysazení 20 tisíc naznačených juvenilních jedinců jesetera malého (A. ruthenus) do slovenské části Dunaje (Čunovo, Sáp, Velkolélský ostrov).
RNDr. Bořek Drozd, Ph.D.
Ve dnech 26.-27.6.2023 navštívili pracovníci FROV JU (Bořek Drozd, Lukáš Veselý, Filip Ložek, Martin Vlk, Jan Kubec a M. Šindler) slovenskou část Dunaje a ramennou soustavu. Provedli zde podrobné mapování a přípravu lokalit pro ichtyomonitoring v rámci projektu LIFE21-IPE-SK-LIFE Living Rivers/101069837.
RNDr. Bořek Drozd, Ph.D.
Svou Ph.D stáž jsem absolvovala na Montpellier Institute of Cancer Research (IRCM), University of Montpellier, Francie. Stáž probíhala v termínu 1. 10. - 31. 12. 2023.
Studie je zaměřena na hodnocení aktivace různých jaderných receptorů člověka a zebřičky ve vzorcích vody. Také jsem testovala 24 čistých sloučenin na buněčných liniích s lidskym a zebřiččím progesteronovym receptorem za účelem pozorování rozdílů v aktivaci.
Během mojí stáže jsem se naučila používat roboty pro provádění in vitro biotestů. Byla jsem také schopná vytvořit si vztahy s dalšími výzkumníky v oboru a probírala jsme vzájemnou budoucí spolupráci.
Testování vzorků z VVI projektu CENAKVA na přístroji Celena X ve společnosti Logos Biosystems SARL
Dne 19. března 2025 jsem v brzkých ranních hodinách odjel z Nových Hradů do Prahy, odkud jsem následně letecky odcestoval do Paříže. Zde jsem přesedl na vlak a dopoledne dorazil do města Lille, kde sídlí společnost Logos Biosystems SARL.
Na místě jsem se setkal s paní Karine Labour (Europe Managing Director) a panem Javierem Garcíou (Field Application Scientist). Po úvodním seznámení s přístrojem Celena X jsme ihned přistoupili k praktickému testování přivezených vzorků, pocházejících z VVI projektu CENAKVA. Testování probíhalo po zbytek dne a pokračovalo také dopoledne následujícího dne.
Dne 20. března odpoledne jsem se přes Paříž vrátil zpět do Prahy a následně autem do Nových Hradů.
Získaná data mi byla poskytnuta ke zpracování a byla prezentována na laboratorním mítinku dne 24. března 2025. Výsledky vzbudily značný ohlas a přispěly k objasnění problémů spojených se vzorky, které nebylo možné adekvátně analyzovat pomocí dostupného přístrojového vybavení v naší laboratoři.
Závěrem lze konstatovat, že pracovní cesta splnila svůj účel a její výsledky představují významný přínos pro další úspěšné pokračování projektu.
Ve dnech 31.3. až 3.4. jsme (Petr Císař, Mohammad Mehdi Ziaei) realizovali instalaci systému pro snímání video záznamů krmení ryb v IFREMER (Montpelier, Francie).
Instalace systému proběhla ve spolupráci s vědci z IFREMER a byla součástí projektu TNA AQUAEXCEl3.0. Cílem projektu je vytvoření automatického monitorování krmení ryb pomocí identifikace ryb ve video záznamu a detekce události sežrání pelety rybou. Takto bude možné monitorovat individuální krmení ryb v hejnu, což otevře nové možnosti výzkumu. V rámci pobytu byl instalován monitorovací systému optimalizovány podmínky snímání.
Od června do září 2023 jsem navštívila INRAE ve Francii kvůli malému výzkumnému projektu v rámci svého studijního plánu financovaného z programu mobility ERASMUS. Studie byla zaměřena na in vitro kultivaci a kryoprezervaci embryoidních těl zebřičky. INRAE bych popsala jako živé výzkumné prostředí a kolegové z laboratoře mě velmi podporovali a vítali. Tato krátká návštěva mi pomohla naučit se nové vědecké techniky a vybudovat nové sítě.
Od 10. ledna do 10. března 2022 jsem absolvovala dvouměsíční stáž v Laboratoři fyziologie a genomiky ryb INRAE v Rennes ve Francii. Během pobytu jsem si osvojila znalosti epigenetiky a bioinformatické analýzy. Byla to skvělá příležitost poznat nové techniky a metody analýzy dat, což je velmi užitečné pro mé doktorské studium. Kromě toho jsem měla možnost spolupracovat s Dr. Catherine Labbé. Tato cesta byla velmi dobrou zkušeností pro rozvoj mých znalostí v oblasti molekulární biologie a technik, které budou užitečné pro mé budoucí výzkumné práce. Ráda bych poděkovala projektu Jihočeské univerzity a grantu ERASMUS+ za financování mého pobytu ve Francii.
Od 18.9 do 20.9. jsem se zúčastnil 13. mezinárodního workshopu o pasivním vzorkování IPSW v Utrechtu v Nizozemsku. Přednesl jsem zde přednášku o perspektivách využití pasivního vzorkování pro různé účely od výzkumu po rutinní monitoring a průmyslové aplikace.
Od 22.9 do 27.9. jsem se pak zúčastnil konference EDAR o rezistenci vůči antibiotikům v životním prostředí v Göteborgu ve Švédsku s plakátovým sdělením „Nontargeted LC-HRMS monitoring data: Fast and reliable way to find compounds and hot spots for prioritization“. Další výsledky naší mezinárodní spolupráce v oboru mikrobiální rezistence v prostředí byly prezentovány v přednáškách Prof. Matse Tysklinda a Dr. Holly Tipper. V rámci této konference také proběhla neformální schůzka členů JPI AMR projektu BIOCIDE, kterého se účastníme.
Během 16.–21. října 2023 jsem navštívila Institut mořské biologie, biotechnologie a akvakultury v „Hellenic Centre for Marine Research“ v Řecku. Praktický trénink byl zaměřen především na inkubaci patogenů in vitro a jejich inaktivaci pro experimenty se stimulací imunitního systému ryb. Dále mi byl vysvětlen management dat, analýza a interpretace výsledků a související teoretické poznatky týkající se infekčních experimentů. S místními výzkumníky byly prodiskutovány možnosti budoucí spolupráce. A měla jsem i příležitost navštívit místní laboratoře a další vědecká oddělení zabývající se akvakulturou. Cesta byla finančně podpořena projektem Erasmus+.
1