Spolupráce & ESFRI

DANUBIUS RI je inovativní mezinárodní výzkumné centrum specializující se na studium řek a moří. Jeho hlavním cílem je zkoumat vzájemné vztahy mezi říčními a mořskými ekosystémy, včetně ústí řek, delt a lagun. 

„Supersite“ jsou klíčovými součástmi distribuované výzkumné infrastruktury DANUBIUS-RI. Slouží jako testovací prostředí pro vědecky excelentní koncepty, které zde budou dále rozvíjeny, ověřovány a aplikovány v reálných podmínkách.

V rámci mezinárodní platformy DANUBIUS  ERIC (European Research Infrastructure Consortium), která je zaměřena na komplexní výzkum sladkovodních ekosystémů zastává CENAKVA roli koordinujícího partnera jednoho z klíčových komponentů distribuované infrastruktury – tzv. SUPERSITE Hydrological Nexus of Central Europe.

eLTER RI /Integrated European Long-Term Ecosystem, critical zone and socio-ecological Research Infrastructure/ je celoevropská výzkumná infrastruktura zaměřená na dlouhodobý výzkum ekosystémů, kritických zón a socio-ekologických systémů. Jejím posláním je podporovat výzkum s vysokým dopadem a přinášet nové poznatky o složitých interakcích mezi člověkem a přírodou v dlouhodobém horizontu.

Centrum CENAKVA na Fakultě rybářství a ochrany vod Jihočeské univerzity je součástí této výzkumné infrastruktury prostřednictvím národní sítě LTER-CZ, kde zastáváme roli českého národního uzlu a spravujeme výzkumnou oblast Labe. Centrum CENAKVA zajišťuje správu výzkumné oblasti řeky Labe a koordinuje aktivity spojené s poskytováním dat uživatelům v režimu otevřeného přístupu.

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích je prostřednictvím Velké výzkumné infrastruktury CENAKVA zapojena jako tzv. core partner v přípravě projektové žádosti s názvem GenoPHEnix. Cílem projektu GenoPHEnix je získání statutu „ESFRI Project“ v nadcházející aktualizaci cestovní mapy Evropského strategického fóra pro výzkumné infrastruktury v roce 2026 (dále jen „ESFRI“). Zakotvení projektu na ESFRI roadmapě otevře možnost zapojení dalších relevantních institucí v České republice do přípravné či implementační fáze projektu.

Projekt GenoPHEnix /a European research infrastructure to deliver consolidated services for research on genome and phenome interactions for terrestrial and aquatic farming systems/ se zaměřuje na propojení genotypizace a fenotypizace hospodářských zvířat, které povede k vytvoření platformy pro živočišné genetické zdroje, k udržitelnému šlechtění s důrazem na zlepšování zdraví zvířat, welfare, odolnosti a účinnosti udržitelné produkce.

CENAKVA spolupracuje s českým nodem evropské iniciativy EOSC /European Open Science Cloud/. V rámci českého EOSC CZ jsme aktivně zapojeni v pracovních skupinách “Environmentální vědy” a “Bio/zdraví/potraviny”. Tato spolupráce nám umožňuje sdílet naše odborné znalosti a přispívat k rozvoji otevřené vědy v Evropě. Můžete zde najít zdroje dat, služba na sdílení nebo soukromé posílání vědeckých dat kolegům a také nástroje a služba na analýzu dat.

ELIXIR RI /Europe's distributed research infrastructure for life science data/ je evropská výzkumná infrastruktura zaměřená na bioinformatiku a správu biologických dat. Poskytuje přístup k datům a podporuje mezinárodní spolupráci v biologických vědách. Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity, jakožto asociovaný partner, je součástí této evropské infrastruktury prostřednictvím ELIXIR CZ. 

ELIXIR CZ (Česká národní infrastruktura pro biologická data) je národní uzel (node) evropské infrastruktury v České republice a funguje jako lokální reprezentace ELIXIR RI, poskytuje služby, nástroje a expertízu české vědecké komunitě, zároveň se podílí na evropských projektech a standardech. Na základě memoranda o spolupráci se Jihočeské výzkumné centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz (CENAKVA) aktivně zapojuje do spolupráce s ELIXIR CZ s cílem posílit propojení mezi oběma výzkumnými infrastrukturami. Tato spolupráce je zaměřena na podporu synergického využívání zdrojů, sdílení odborných znalostí a rozvoj společných infrastrukturních projektů.