Velká výzkumná infrastruktura CENAKVA
Náplní velké výzkumné infrastruktury CENAKVA (LM2018099, LM2023038) je porozumění změnám ve sladkovodních ekosystémech a jejich celospolečenské závažnosti z hlediska zachování biodiverzity, ochrany vodního prostředí a vodních zdrojů důležitých pro život a činnost člověka. Velká výzkumná infrastruktura CENAKVA pokrývá infrastrukturní, znalostní a expertní zázemí Fakulty rybářství a ochrany vod a Jihočeské výzkumné centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz a umožňuje otevřený přístup k 25% jejich kapacity.
Velká výzkumná infrastruktura CENAKVA funguje na principu otevřené infrastruktury pro experimentální činnost, která zahrnuje celkem 12 konkrétních laboratoří a výzkumných pracovišť.
Služby a infrastrukturu mohou využívat výzkumníci z celého světa prostřednictvím otevřeného přístupu. Otevřený přístup umožňuje zdarma realizovat experiment a využít expertíz, kterými infrastruktura disponuje. Pro realizaci experimentu stačí připravit projekt přístupu, který je hodnocen ve dvou stupních z pohledu kvality výzkumu, technické způsobilosti a dostupnosti infrastruktury. Úspěšné projekty jsou pak realizovány za technické a vědecké asistence zaměstnanců infrastruktury.
Neváhejte a přihlaste se svým experimentem! Výzva pro podávání projektů je otevřena nepřetržitě!
Žadatel vyplní elektronicky formulář se strukturovaným životopisem a vyčká na hodnocení projektu a rozhodnutí, zda se projekt bude realizovat.
Infrastruktura a služby nabízené v rámci otevřeného přístupu
| Experimentální rybochovné pracoviště a pokusnictví (ERPP) | |
| 12 venkovních kruhových nádrží v průtočném režimu o objemu 1500l |  |
| 6 vnitřních nádrží v recirkulačním systému o objemu 800l – používané k realizaci experimentů zaměřených na chovatelské technologie v akvakultuře |  |
| Laboratoř environmentální chemie a biochemie (LECHB) | |
| Dvoudimenzionální kapalinový chromatograf s vysokorozlišujícím hmotnostním spektrometrem (QExactive) – analytický přístroj používaný k cílené analýze léčiv, pesticidů, hormonů, UV filtrů, perfluorovaných látek a dalších mikropolutantů převážně v biologických vzorcích vodních organismů a rostlin |  |
| Dvoudimenzionální kapalinový chromatograf s vysokorozlišujícím hmotnostním spektrometrem (QExactive-HF) – analytický přístroj pro cílený a necílený screening vodního prostředí |  |
| Dvoudimenzionální kapalinový chromatograf s hmotnostním spektrometrem na bázi trojitého kvadrupólu (Quantiva) – analytický přístroj používaný pro kvantitativní stanovení léčiv a pesticidů ve vzorcích vod, pasivních vzorkovačů, půd, kalů a sedimentů |  |
|
TSQ Altis je trojitý kvadrupólový hmotnostní spektrometr vhodný pro kvantitativní analýzu hladin zbytkových koncentrací sloučenin; Iontový zdroj umožňuje použití zahřátého elektrospreje nebo chemické ionizace; Dvourozměrný systém kapalinové chromatografie umožňuje online extrakci pevnou fází vhodnou pro analýzu zbytků znečišťujících látek v matrici vzorku vody; Jednotka Autosampler má kapacitu až 324 vzorků; Analýza 109 léčiv, 110 pesticidů a jejich metabolitů; Typy vzorků – půda, kal a extrakty pasivního vzorkovače, vodní matrice; Limity kvantifikace – ng/mL (extrakty), ng/L vody.
|
 |
| Laboratoř řízené reprodukce a intenzivního chovu ryb (LRICH) | |
| Experimentální recirkulační systém pro růstové testy na rybách. K dispozici je kompletně vybavený systém s modulárním uspořádáním. |  |
| Samokrmítkový systém pro distribuci (dávkování přesných množství krmiv) krmiv a hodnocení počtu požadavků ryb na krmivo. Software umožňuje vytváření krmných protokolů a hodnocení potravního chování ryb. Software umožňuje kontrolu chovu ryb na třech úrovních (přehled o chovaných rybách, vývoj v reálném čase a detail každé chovné nádrže) |  |
| Kompletní systém plavacích tunelů/ respirometrů pro počítačově asistovanou přerušovanou respirometrii. Systém umožnuje plně automatizované měření spotřeby kyslíku, hodnocení schopností plavání (Ucrit) ryb a chování ryb. Pro studie zaměřené na biomechaniku a fyziologii plavání v kombinaci s metabolickými a etologickými studiemi. |  |
| Laboratoř fyziologie reprodukce (LFR) | |
| Hodnocení kvality a pohyblivosti spermií (včetně pohybu bičíku) před a po kryokonzervaci. Nabízí několik mikroskopů připojených k digitálním a analogovým videokamerám, pokrývá různé kontrastní metody (BF, DF, PH), teplotní rozpětí (4-37°C), frekvenci snímků (5-5000 FPS), zvětšení (až x100) a rozlišení (až 3200x1800) během záznamů motility. |  |
| Laboratoř vodní toxikologie a ichtyopatologie (LVTI) | |
| Analýzu genové exprese a další biochemické analýzy. Přístrojové vybavení: Real-Time PCR cycler + Bioanalyzer + Nanodrop, Spektrofotometr s fluorescenčním a luminiscenčním modulem Infinite M200PRO (TECAN) + dvou paprskový spektrometr (SPECORD). |  |
| Histopatologického vyšetření tkání vodních organizmů – je založené na kompletním zařízení pro přípravu a analýzu histologických preparátů tkání organizmů. Přístrojové vybavení: odvodňovací automat Histomaster (Model 2052/1,5), modulární zalévací parafínová linka (Leica EG1150), poloautomatický rotační mikrotom, automatická barvící linka (TISSUE-TEK® DRS™ 2000, SEKURA) a mikroskopem (MOTIC). |  |
| Laboratoř intenzivní akvakultury (LIA) | |
| Dvě identické experimentální místnosti pro reprodukci a intenzivní chov ryb. V každé místnosti se nachází devět nádrží o objemu 360 L napojených na kompletní RAS s možností zde řídit světelný a teplotní režim. Odchovné systémy je také možné využít na experimenty spojené s finální reprodukcí ryb, odchovem juvenilních ryb při různých hustotách obsádek, managementu krmení s využitím samokrmítek a různým obsahem rozpuštěného kyslíku ve vodě. |  |
| Plně aklimatizovaná místnost je kompletně vybavena pro intenzivní chov studenomilných ryb (lososovité a síhovité druhy) a dále pro stimulaci mimosezónních výtěrů různých druhů ryb. Tato místnost obsahuje 4 nádrže o objemu 1500 L a 6 nádrží o objemu 360 L, které jsou napojené na kompletní RAS. |  |
|
Experimentální hala pro intenzivní chov ryb o celkové kapacitě dvaceti 1500 L nádrží zapojených do dvou oddělených RAS. Toto vybavení je možné využít pro poloprovozní experimenty s pojené s optimalizací intenzivního chovu ryb z hlediska kvality vody, managementu krmení, výživy, hustoty obsádek, třídění ryb, využití ozónu atd. |
 |
| Laboratoř molekulární, buněčné a kvantitativní genetiky (LMBKG) | |
| Kapilárový automatický sekvenátor Applied Biosystems 3500 a sekvenátor nové generace Ion Torrent™ PGM pro sekvenování mitochondriálních a nukleárních genů. Sekvenace genů je používána především k přiřazení rodičovského páru, určení monosexních obsádek ryb a studiu vzájemného genetického a molekulárně biologického postavení populací ryb a korýšů. |  |
| Průtokové cytometry Partec CCA-I a CyFlow® Cube 8 ke stanovení úrovně ploidie na základě zjištění relativního množství DNA v jádrech somatických buněk ryb, případně jejich gamet, obarvených DNA-specifickými barvivy. Další možností je stanovení počtu a koncentrace měřených částic. |  |
| Laboratoř zárodečných buněk (LZB) | |
| Zebrafish housing systém – poloautomatický systém na odchov malých druhů ryb a rozkrm larev |  |
| Systém pro manipulaci a injikaci rybích embryí – systém je vhodný od prvních stádií po oplození až po larvální stádia. |  |
| Analyzátor relativního obsahu DNA – uživatelsky přívětivý průtokový cytometr je vhodný pro hodnocení relativního obsahu DNA v jádrech buněk. |  |
| Kapilárová elektroforéza – elektroforetický systém s rozlišením do třech bází je vhodný především pro přesnější stanovení velikosti PCR produktů. |  |
| Laboratoř strojového vidění v akvakultuře a ochraně vod (LSVAOV) | |
| Monitorovací systémy pro etologické studie ryb - založené na 3D kamerách umožňují automatizovaný záznam a vyhodnocení chování ryb v akváriích a nádržích |  |
| Hyperspektrální kamera - Skenování a analýza vzorků pomocí hyperspektrální kamery, analýzy odrazivosti povrchu materiálů, které jsou posléze korelovány s obsahem látek či složením materiálu, typická úloha je analýza vzhledu ryb při použití různých diet, skenovací kamera umožňuje zpracování libovolných materiálů – viditelné + blízké infračervené spektrum |  |
| Laboratoř výživy (LV) | |
| Akvaponická hala obsahující 6 nezávislých recirkulačních akvakulturních systémů se sběrem odpadní vody a mineralizací kalů. 200 metrů čtverečních skleníku s čtyřmi typy (raftové, záplavové, kapénkové a aeroponické systémy) hydroponických systémů (každý min 6 opakování). |  |
| Chromatografická laboratoř včetně přípravny vzorků pro komplexní analýzy krmiv, masa ryb, výkalů a dalších matric. Přístroje zastoupené v laboratoři jsou: GC-MS, HPLC, HPTLC, Maldi-tof. |  |
| Plně vybavená zpracovna ryb pro výrobu a vývoj rybích výrobků (chlazené, mrazené, uzené, vařené, marinované), včetně analytického zázemí pro studium postmortálních změn v rybím mase a hodnocení kvality rybích výrobků |  |
| Laboratoř sladkovodních ekosystémů (LSE) | |
| EthoVision® XT set-up – etologický software s vybavením (hardware, kamerový systém, arény) v etologické laboratoři. Etologické sledování vodních živočichů a automatické vyhodnocování jejich životních projevů. Možnost sledování až 96 arén najednou. |  |
| Simulátor průtočných podmínek pro ryby a raky. Umožňuje simulovat podmínky tekoucích vod pro experimentální sledování ryb a raků |  |
| Akvarijní místnost. Slouží pro uchování a chov raků a pro provádění experimentů. |  |
| Sestava inkubátorů ve velké laboratoři. Umožňuje uchování vodních organismů a provádění experiment v teplotně specifickém prostředí (4 – 40°C). |  |
| Systém na detekci srdeční aktivity raků a mlžů. Umožňuje neinvazivní sledování srdeční aktivity raků a mlžů v laboratorních podmínkách. |  |
| Prostory pro odchov a experimentální udržování ryb nebo raků (venkovní a vnitřní žlabovna). Slouží pro uchování a chov ryb a raků a pro provádění experimentů, jak v přírodních, tak kontrolovaných podmínkách (včetně možnosti recirkulace vody). |  |
| DanioVision® set-up s příslušenstvím v samostatné laboratoři. Systém umožňující sledování vývoje a životních projevů (včetně srdeční aktivity) vodních organismů v období embryonálního a postembryonálního vývoje v řízených teplotních I světelných podmínkách. |  |
| Odběr vzorků vody a hydrobiontů (ryby, zoobentos, zooplankton, fytoplankton) ve sladkých vodách (rybníky vč. přítoků, odtoků, tekoucí vody různého typu, mělká jezera) v ČR, měření základních fyzikálně- chemických parametrů vody, zpracování a analýza vzorků. |  |
| Prostory pro ekologické a etologické sledování hydrobiontů, sledování potravního chování hydrobiontů (zejména ryb či makrozoobentosu), experimenty na zooplanktonu a fytoplanktonu, provádění pokusů a sledování na raných stádiích ryb, ověření účinnosti různých postupů nebo preparátů při umělé reprodukci ryb. |  |
Spolupracující infrastruktura
|
Katedra techniky a kybernetiky Studentská 1668, 370 05 České Budějovice |
|
|
Fotoakustický analyzátor plynů – Innova 1512 K dispozici od 01/2022
Analyzátor dokáže současně sledovat koncentraci CO2, NH3 a vodní páry v jakémkoliv vzorku vzduchu na principu fotoakustické infračervené spektroskopie. Zařízení je vhodné a velmi efektivní pro krátkodobé i dlouhodobé monitorovací aplikace. Při krátkodobém monitorování je výhodou přenositelnost, minimální doba zahřívání a vestavěná možnost ukládání dat. Při dlouhodobém monitorování je systém obzvláště stabilní, zahrnuje možnost vícebodového vzorkování a zpracování dat. Zařízení je vybaveno převodníkem schopným odebírat vzorky až z 12 různých míst a může pracovat v obtížných mikroklimatických podmínkách, jako jsou například chovy hospodářských zvířat. Detekční limit pro CO2 je 13 ppm a pro NH3 je 0,20 ppm.
Kontaktní osoba: Ing. Radim Kuneš, Ph.D. E-mail: Tel.: +420 606 263 674 |
|
|
Laboratoř Molekulární integrativní biologie Drosophily, Branišovská 1760, 370 05 České Budějovice |
|
|
High-resolution 3D X-ray microscope K dispozici od 02/2022
Vizualizace složitých vnitřních struktur biologických objektů bez nutnosti jejich dezintegrace fixací a přípravou mikroskopických preparátů je jednou z výzev moderní biologie. Série stovek rentgenových snímků rotujícího objektu umožňuje následnou 3D rekonstrukci objektů a jejich vnitřních struktur s rozlišením menším než pět μm. Zařízení lze použít ke skenování různorodých objektů včetně rostlin, kamenů, kompozitních materiálů, stavebních materiálů a dokonce i živých zvířat. Kombinace přirozených kontrastních vlastností biologických struktur se specifickými kontrastními látkami a protilátkami poskytuje nekonečný potenciál pro uplatnění tohoto nástroje ve výzkumu.
Kontaktní osoba: Mgr. Adam Bajgar, Ph.D. E-mail: Tel.: +420 387 772 227 |
 |
Zpoplatněné SLUŽBY - externí spolupráce
Open DATA
Žádost o data je dostupná zde.
Dlouhodobý environmentální výzkum povodí Labe
Pro více informací se obraťte na kontaktní osobu: Jaroslava Dubová, BBus., E-mail:
Datová sada byla vytvořena pro vytvoření metod identikace ryb stejného druhu z fotografie ryby. Dataset obsahuje obrázky ryb focených mimo vodu a pod vodou pro čtyři druhů ryb (losos – 300 kusů, kapr - 32 kusů, mořčák – 300 kusů, parmička čtyřpruhá – 42 kusů). Ryby jsou foceny ze strany, tak aby byl viditelný vzor na rybě, který se použil pro identifikaci ryb. Většina ryb byla označena pomocí PIT značek pro jednoznačnou identifikaci.
Popis dat je možné nalézt v těchto článcích: losos, kapr, mořčák, parmička čtyřpruhá.
Obrázky vzorů ryb pro identifikaci vytvořené Petrem Císařem, Dinarou Bekkozhayevou, Mohammadmehdim Saberioonem a Rudolfem Schramlem jsou chráněny licencí CC BY-SA 4.0
Pro více informací se obraťte na kontaktní osobu: Jaroslava Dubová, BBus., E-mail:
Datový soubor ke studii zkoumající různé strategie krmení juvenilů candáta obecného (Sander lucioperca) v recirkulačním akvakulturním systému (RAS) po dobu 112 dnů. Chovný experiment porovnával pět různých intervalů krmení (2 hodiny, 4 hodiny, 6 hodin, 8 hodin a 12 hodin) s pomocí automatického dávkovače krmení Imetronic® (Pessac, Francie). Výsledky ukázaly, že kratší intervaly krmení vedly k vyšší heterogenitě růstu ryb a k mírně zvýšenému poškození ploutví. Nicméně všechny testované frekvence krmení poskytly dostatek živin pro správný růst a pohodu candátů. Osmihodinový Interval krmení byl identifikován jako optimální, podporující lepší podmínky pro ryby (Fultonův koeficient), specifickou míru růstu, míru přežití, nižší poškození ploutví ve srovnání s ostatními testovanými frekvencemi a optimální úroveň biochemických parametrů v krevní plazmě.
Data studie monitorující znečištění řeky Dunaj. Byl Použit inovativní přístup kombinující pasivní sběr vzorků s chemickou a bioanalytickou analýzou v rámci průzkumu JDS4. Studie se zaměřuje na použití dvou typů pasivních vzorkovačů - silikonových disků pro hydrofobní látky a AttractSPETM HLB disků pro hydrofilní látky. Tyto pasivní vzorkovače byly umístěny na devíti místech v řece Dunaji po dobu přibližně 100 dnů. Bylo zaznamenáno znečištění přes 400 chemickými látkami, které zahrnovaly průmyslové látky, farmaka a produkty osobní péče a pesticidy. Byly identifikovány rizikové látky a typy in vitro biologických aktivit. Nový přístup s dlouhodobým pasivním vzorkováním poskytuje reprezentativní přehled o znečištění řeky Dunaj a může být využit pro budoucí monitorování vodní kvality.
Další otevřené datové sady můžete nalézt také pod naší komunitou na repozitáři pro open science Zenodo. Detaily o otevřené vědě na fakultě jsou k dispozici zde.
Proces podání projektu
- Výzva pro podávání projektů je otevřena nepřetržitě
- Žadatel vyplní formulář pro externí / interní přístup
- Interní přístup – zaměstnanci Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích
- Externí přístup - ostatní
- Zašle elektronickou verzi formuláře dohromady se strukturovaným životopisem manažerovy výzev: Jaroslava Dubová -
Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript. – předmět emailu: OPEN ACCESS - Vyčká na rozhodnutí o hodnocení projektu
- V případě přijetí projektu k realizaci:
- Manažer výzev zašle žadateli smlouvu o přístupu – žadatel zašle vyplněnou a podepsanou smlouvu zpět manažerovi výzev
- Hlavní řešitel projektu se přímo domlouvá na realizaci projektu s vedoucím příslušné laboratoře
Realizované projekty
Seznam vybraných projektů
Hlavní řešitel : Prof. Riho Gross
Období projektu : 03.06.2019 / 21.06.2019
Laboratoř : Laboratoř molekulární, buněčné a kvantitativní genetiky
Číslo projektu : 2019-02-22
Projekt byl zaměřen na sběr vzorků tkání generačních sumců plemen založených na GRC FROV JU a charakterizaci genetické variance uvnitř plemen/rodin a mezi nimi a pro určení rodičovství v rodinách jejich potomstva za použití mikrosatelitního genotypování a sekvenace nové generace. Po výběru a kvalitativním hodnocení reprodukční užitkovosti byly faktoriálním křížením 6 samic a 6 samců za každé plemeno založeny sourozeneckéa polosourozenecké rodiny. Po inkubaci jiker a vykulení byl plůdek letecky přepraven do Estonska ke komparativnímu vyhodnocení užitkovosti plemen a rodin a k odhadu heritability produkčně významných vlastností.
Publikace zde: https://academic.oup.com/g3journal/article/10/11/3897/6048642
Hlavní řešitel: Dr. Dipl.-Hyd. Jakob Schelker
Doba trvání projektu: 02.03.2020 / 24.03.20
Laboratoř: Laboratoř environmentální chemie a biochemie
Číslo projektu: 2020-01-63
Potoky a řeky metabolizují rozpuštěnou organickou hmotu (DOM). Ačkoli většina sloučenin DOM pochází z přírodních zdrojů, rekreačním používáním řek vzniká významné množství DOM antropogenního původu. Cílem této studie bylo jednak prozkoumat antropogenní vliv na nárůst DOM v řece Traisen v Rakousku během hudebního festivalu a jednak vyzkoušet fluorescenční spektroskopii pro monitorování DOM. Jako hlavní zdroj antropogenního znečištění byly nalezeny krémy na opalování a zejména jejich složka kyselina fenylbenzimidazol sulfonová (PBSA). To bylo potvrzeno nejen fluorescenční metodou, ale také LC-MS (kapalinová chromatografie ve spojení s hmotnostní spektrometrií) analýzou vzorků vody v Laboratoři environmentální chemie a biochemie.
Publikace zde: https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.est.0c02259
Hlavní řešitel : Alexander Rebl, Ph.D.
Období projektu : 01. 08. 2020/ 31. 08. 2020
Laboratoř : Laboratoř řízené reprodukce a intenzivního chovu ryb
Číslo projektu : 2020-03-75
Okoun říční, Perca fluviatilis, je velmi slibným kandidátem na diverzifikaci sladkovodní akvakultury. Má velký potenciál dodávat produkty senzorické kvality a nutriční hodnoty podle požadavků trhu v EU. Evropské produkci okouna však často brání vysoká citlivost vůči stresu v zajetí, což má negativní dopad na imunitu a zároveň zvýšení citlivosti k nemocem a patogenům. Pro úspěšnou prevenci nemocí jsou požadovány podrobné informace o molekulárních mechanismech imunitních odpovědí mezi geograficky odlišnými evropskými populacemi okouna proti různým patogenním podnětům. K překonání této překážky jsme vytvořili in vitro model zánětu pomocí stimulace leukocytů hlavové ledviny lipopolysacharidem (LPS), který je hlavní složkou vnější membrány gramnegativních bakterií. Za tímto účelem byly izolovány leukocyty hlavové ledviny ze čtyř různých evropských populací okounů (Francie I a II, Dánsko, Maďarsko) pomocí centrifugace s hustotním gradientem a stimulovány LPS (100 µg/ml) po dobu jedné hodiny. Po inkubaci bylo změřeno respirační vzplanutí pomocí dihydrorhodaminu 123.
Publikace zde: https://www.researchgate.net/publication/346714561_DEVELOPMENT_OF_IN_VITRO_MODEL_FOR_STUDIES_OF_INFLAMMATORY_PATHWAY_IN_EUROPEAN_PERCH
Hlavní řešitel : Ing. Lucie Vištejnová, Ph.D.
Období projektu : 01.11.2019/ 31.12.2019
Laboratoř : Laboratoř experimentálních komplexních systémů
Číslo projektu : 2019-04-53
Jednou z klíčových odpovědí buněk na materiálech na bázi kolagenu je mechanismus jejich adheze na povrch materiálu a jejich lokomoce a proliferace na něm. Cílem tohoto projektu je proto vyhodnotit adhezi, šíření a pohyb buněk na kolagenu pocházejících z různých druhů savců a extrahovaných různými metodami. Abychom získali informace o buněčné struktuře a dynamice, museli jsme vyvinout příslušný software, pro který jsme vyvinuli nové statistické metody pro hodnocení fyzikálních parametrů. Jako první na světě jsme schopni určit spektra jednotlivých organel, lokální difúzi, lokální směrovaný tok uvnitř živé savčí buňky a mnoho dalších parametrů.
Publikace zde: https://www.nature.com/articles/s41598-020-75441-7
Hlavní řešitel : Prof. Andreas Uhl
Období projektu : 23.11.2020/ 20.12.2020
Laboratoř : Laboratoř zpracování signálu a obrazu
Číslo projektu : 2020-04-96
Tzv. „precision fish farming“ je novým konceptem v akvakulturním výzkumu a průmyslu, který kombinuje nové technologie a metody zpracování dat, aby umožnil rozhodování založené na datech v chovu ryb. Koncept je založen na automatizovaném monitorování ryb, infrastruktury a životního prostředí, ideálně bezkontaktními metodami. Identifikace jednotlivých ryb stejného druhu v daném hejnu je rozhodující pro individualizované nakládání s rybami, odhad biomasy a stanovení stavu ryb. Standardní způsob identifikace ryb je invazivní značení. Projekt testuje možnosti dlouhodobé identifikace ryb na základě obrázků vzoru oka. Úspěšně jsme prokázali, že vzor oka lze použít k identifikaci jednotlivých ryb a může být použit jako plně bezkontaktní metoda nahrazující invazivní značení ryb.
Publikace zde: https://ieeexplore.ieee.org/document/9133326
Hlavní řešitel : MSc. Astrid Sibylle Holzer, Ph.D
Období projektu : 01.06.2019/ 02.08.2019
Laboratoř : Laboratoř intenzivní akvakultury
Číslo projektu : 2019-01-12
Hlavním cílem projektu bylo otestovat aplikaci uměle vyprodukovaných vířníků druhu Brachionus plicatilis jako první exogenní výživy u intenzivně chovaných larev candáta obecného (Sander lucioperca). V rámci projektu se otestovalo probiotikum založené na bakteriích mléčného kvašení Pediococcus acidilactici v rámci přípravku Bactocell Aqua 100. Tento přípravek se testoval v podobě zapravených bakterií do těla vířníků či obohacené vody o bakterie, která se využívala k odchovu larev. V další studii projektu se testoval vliv obohacení produkovaných vířníků o nenasycené mastné kyseliny (PUFA – EPA a DHA) pomocí uměle kultivované řasy rodu Chlorela nebo přípravku Selco, Spresso od firmy INVE z Belgie. Snahou obou studií bylo zvýšit přežití a fyziologickou odolnost odchovávaných larev candáta s cílem produkovat kvalitní juvenilní ryby k dalšímu průmyslovému chovu.
Publikace zde: https://www.mdpi.com/2076-2607/8/2/238
Seznam realizovaných projektů
| 2022 | ||
| Číslo projektu |
Název projektu |
Země řešitele |
|---|---|---|
| 2022-01-147 | Genotoxic effect of dietary on sturgeon | Polsko |
| 2022-01-148 | Save the crucian carp | Česká republika |
| 2022-01-149 | Identification of origin of two Coregonus specises in lakes Most and Medard | Česká republika |
| 2022-01-150 | Anthropogenic impacts on the self-purification capacity of a river - Studies on possible causes and effects of altered river morphology on the removal of pharmaceuticals and heir residues | Rakousko |
| 2022-01-151 | Bioanalytical and analytical assessment of the anti-progestagenic and anti-thyroid organic micropollutants in Czech aquatic environment | Česká republika |
| 2022-01-152 | Effect of different light regime on survival, growth and culture efficiency in Northern pike larvae and juveniles under controlled conditions of intensive aquaculture | Ukrajina |
| 2022-01-153 | Possibilities of intensive rearing of Danube salmon (Hucho hucho) in RAS | Slovensko |
| 2022-01-154 | Effect of different doses of astaxanthin supporting growth and colour production in red-white ornamental koi carp (Cyprinus carpio) in intensive aquaculture | Česká republika |
| 2022-01-155 | The optimalization and utilization feeding frequency in pikeperch (Sander lucioperca) intensive aquaculture | Česká republika |
| 2022-02-156 | Cryopreservation of trout sperm in containers of big volume | Česká republika |
| 2022-02-157 | Bioactive and nutritionally important compounds profile of vegetables grown in soilless systems | Česká republika |
| 2022-02-158 | Development of the marbled crayfish diet | Česká republika |
| 2022-02-159 | Analysis of Czech wastewater samples for identification and quantification of illicit drugs | Česká republika |
| 2022-02-160 | In vivo and in vitro aging of common carp Cyprinus carpio sperm after multiple hormonal application and stripping of males | Česká republika |
| 2022-02-161 | Chemcatcher Screening - River Test and Itchen, UK | UK |
| 2022-02-162 | Analytical characterization of UV filters in Czech surface waters | Česká republika |
| 2022-02-163 |
Effect of dietary supplementation with dragon fruit (Hylocereus undatus) peel powder on growth performance, immunological response, and immune-antioxidant gene expression of Nile tilapia (Oreochromis niloticus) cultivated in a biofloc systém |
Thajsko |
| 2022-02-164 | The role of K+ (Slo1-type) channels in rainbow trout spermatozoa motility | Česká republika |
| 2022-03-165 | Foraging behaviour of marbled crayfish with a different limbs injuries | Francie |
| 2022-03-166 |
Effect of different stocking density on growth performance of Siberian sturgeon (Acipenser baerii) and Russian sturgeon (Acipenser gueldenstaedtii) juveniles in recirculating aquaculture systems |
Česká republika |
| 2022-03-167 | Test of fish identification in infrared and visible spectra for sorting machine | USA |
| 2022-03-168 | The effect of Acorus calamus on algae growth | Česká republika |
| 2022-03-169 | Hydroponics vs. Aquaponics: Growth of greenhouse crops in different soilless systems | Česká republika |
| 2022-03-170 | Micropollutants in water and sediment | Česká republika |
| 2022-03-171 | SOME INSIGHTS INTO FATTY ACID AND ENERGY METABOLISM OF A COLDWATER PERCH SPERM: NUTRITION & KINETICS | Česká republika |
| 2022-03-172 | Elevated temperature promotes spermatozoa motility kinetics and fertilizing ability following short-term storage in common carp, Cyprinus carpio | Írán |
| 2022-03-173 | Dynamics of zooplankton and macrozoobentos community together with natural diet of common carp in fishponds | Polsko |
| 2022-03-174 | Visual system in induced polyploid and hybrid sturgeons | Česká republika |
| 2022-03-175 | Visual system of the starry sturgeon (Acipenser stellatus), a species without rod cells in retina | Česká republika |
| 2022-03-176 | The impact of UV light on the morphological changes in mammalian cells. | Česká republika |
| 2022-03-177 | Development of a method for instance segmentation of live cells | Albánie |
| 2022-03-178 | The classification of the cell phases according to the spectral properties of the intracellular regions | Srbsko |
| 2022-03-179 | Bioinformatic analysis of enzymes within central carbon metabolism of cyanobacteria | Albánie |
| 2022-03-180 | Linkages between temperature, diel cycles, and metabolic rates in juvenile and adult Procambarus virginalis | USA |
| 2022-03-181 | Utilization of crayfish tissue cells for in vitro screaning of environemntal aquatic pollutants at celular levels | Česká republika |
| 2022-04-182 | Circadian rhythm of marbled crayfish influnced by reproductive status | Česká republika |
| 2022-04-183 | Image analysis of human bone-derived cell lines (MG-63, SaOs-2) on diverse titanium surfaces | Česká republika |
| 2022-04-184 | Influence of cryopreservation and Percoll gradient separation on Acipenser ruthenus sperm quality | Česká republika |
| 2022-04-185 | Analysis of DNA damage repair in non-model fish species | Česká republika |
| 2022-04-186 | Development and validation of a simple and fast quantitative screening method for a broad spectrum of environmental pollutants | USA |
| 2022-04-187 | Can stress conditions extend the maternal care and juvenile development in parthenogenetic marbled crayfish | Česká republika |
| 2022-04-188 | Respirometry and cardiac activity in crayfish | Česká republika |
| 2022-04-189 | Stimulating the mucosal immunity of rainbow trout () in recirculating aquaculture systems to increase natural defense mechanisms | Česká republika |
| 2022-04-190 | Image analysis of MSCs - T-cell interaction | Rakousko |
| 2022-04-191 | Annotation of videos of ornamental fish under controlled conditions and training the neural network | Česká republika |
| 2021 | ||
| Číslo projektu |
Název projektu |
Země řešitele |
|---|---|---|
| 2020-03-79 | Effect of elevated temeprature on trophic relationship of marbled crayfish in food webs of Hevíz lake and their chanels | Maďarsko |
| 2021-01-98 | Israel Chemcatcher Screening | UK |
| 2021-01-99 | Effects of dietary protein and soybean meals on growth perfromance, body composition, blood biochemistry in pikeperch (Sander lucioperca) | Ukrajina |
| 2021-01-100 | Optimization of the intensive rearing of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss in RAS) | Česká republika |
| 2021-01-101 | Effect of sinking and floating feed in the rearing of European pike perch (Sander lucioperca) | Česká republika |
| 2021-01-102 | Analysis of macroergic phosphates and metabolites in sterlet spermatozoon | Česká republika |
| 2021-01-103 | Analysis of macroergic phosphates and organic acids in sperm of stingrays during storage | Česká republika |
| 2021-01-104 | Occurrence of (anti-)progestagenic activities in Czech wastewaters and surface waters | Česká republika |
| 2021-01-105 | Non-targeted screening and quantification of cortisol in stugeons´ plasma | Česká republika |
| 2021-01-106 | Phenotype modifications and functional properties during fish sperm aging | Česká republika |
| 2021-01-107 | Optimization of Sperm Management and Fertilization in Zebrafish [Danio rerio (Hamilton) | Česká republika |
| 2021-01-108 | Effect of anti-progestagenic activities on Xenopus leavis | Neměcko |
| 2021-02-109 | Choosing the best diet for the aging fish model -turquoise killifish | Česká republika |
| 2021-02-110 | The cognitive ability of fish during food intake in a new environment after restocking | Česká republika |
| 2021-02-111 | Evaluation of different approaches for fish plasma sampling with respect to environmental risk assessment of pharmaceuticals | Švédsko |
| 2021-02-112 | Stress response and DNA damage in mosaic sturgeon (Acipenser ruthenus) larvae | Česká republika |
| 2021-02-113 | The effect of in-vitro oocyte ageing and highly concentrated sperm insemination on the incidence of spontaneous autopolyploidy and mosaicism in sterlet | Česká republika |
| 2021-02-114 | Behaviour and fitness in cultured asp (Leuciscus aspius) | Česká republika |
| 2021-02-115 | IN-VITRO CELL LINE CULTURE BEHAVIOUR AFTER IMPLICATION OF FULL-SPECTRUM CANNABIS SATIVA L. EXTRACTS. | Česká republika |
| 2021-02-116 | Improvement of acoustic conditions for audio recordings of fish in standard rectangular glass aquariums | Francie |
| 2021-02-117 | Carp sperm short-term storage | Polsko |
| 2021-02-118 | Living lymphocytes evaluation for diagnostic purposes, possibilities of replacement of manual observation at different optical magnifications by digital magnification and processing | Česká republika |
| 2021-02-119 | Mesenchymal stem cells growth in constrained environment | Rakousko |
| 2021-02-120 | Analysis of energetic metabolites in carp spermatozoa during storage | Polsko |
| 2021-02-121 | Investigating the specification of hair cells versus electroreceptors in the lateral line using CRISPR/Cas9 in sterlet | UK |
| 2021-02-122 | Quantification of selected antibiotic, other pharmaceuticals and pesticides in passive samplers exposed in lake Malawi, Africa | UK |
| 2021-03-123 | Fabrication, stability and rheological properties of zein/chitosan particles stabilized Pickering emulsions with antioxidant activities of the encapsulated vit-D3. | Česká republika |
| 2021-03-124 | Investigation of the physiological mechanisms underpinning pharmaceutical-induced behavioural alterations | Švédsko |
| 2021-03-125 | Influence of ploidy level of different Acipenseridae species on optimal spermatozoa concentration for cryopreservation | Česká republika |
| 2021-03-126 | Effect of temperature on food sources are incorporation into fish body | Rakousko |
| 2021-03-127 | Burst swimming speed testing in Prussian carp (Carassius gibelio) | Česká republika |
| 2021-03-128 | Triploidization in pikeperch (Sander lucioperca) induced by cold shock | Česká republika |
| 2021-03-129 | Motility of diplonemids | Česká republika |
| 2021-03-130 | Immune response of porcelain disease infected crayfish | Chorvatsko |
| 2021-04-131 | Ploidy level analysis in collected samples of the genus Carassius | Česká republika |
| 2021-04-132 | Vizualization of acrosome reaction in sturgeon spermatozoa | Polsko |
| 2021-04-133 | Pickering emulsion stabilized Andrographolide: A bioactive diet supplimenting growth, digestibility, immunity and viral resistance in Cyprinus carpio. | Česká republika |
| 2021-04-134 | Effect of four different feed formulations on the growth and digestibility of African catfish (Clarias gariepinus) juveniles | Česká republika |
| 2021-04-135 | Fish Mass Estimation in RAS using 3D Camera | Česká republika |
| 2021-04-136 | Fish individual identification under real conditions | Rakousko |
| 2021-04-137 | Intermitent respirometry in three cichlids species under normoxic and hypoxic conditions | Česká republika |
| 2021-04-138 | Factors affecting the prey-predator interactions | Česká republika |
| 2021-04-139 | The nerve regeneration in crayfish | Česká republika |
| 2021-04-140 | Optimization of mutagenesis by CRISPR/Cas9 in sturgeon | USA |
| 2021-04-141 | Verification of sex genomic markers in Siberian sturgeon (Acipenser baerii) | Polsko |
| 2021-04-142 | Evaluation of new industrial schooling aquarium | Česká republika |
| 2021-04-143 | Pike pearch meat analysis using multispectral camera | Česká republika |
| 2021-04-144 | Comparison of performance of new NanoTruth optical microsope with Scanning electron microscope | Česká republika |
| 2021-04-145 | Development and testing of basic controls of performance of new NanoTruth optical microscope | Česká republika |
| 2021-04-146 | Intermitent respirometry in three cichlids species under normoxic and hypoxic conditions/2 | Česká republika |
| 2020 | ||
| Číslo projektu | Název projektu | Země řešitele |
|---|---|---|
| 2020-01-55 | Use of humic substances in nutrition of Oncorhynchus mykiss juveniles | Německo |
| 2020-01-56 | Effects of dietary protein and lipid levels on growth perfromance, body composition, blood biochemistry and ammonia excretion in European grayling (Thymallus thymallus) | Čína |
| 2020-01-57 | Combined supplementation of vitamin C and E for attenuating the oxidative damages induced by oxidized fish oil in rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) | Česká republika |
| 2020-01-58 | Family assignment of broodstock fish of common carp to eliminate inbreeding | Česká republika |
| 2020-01-59 | Effect of thermal aclimation on functional response parameters of marbled crayfish (Procambarus virginalis) | Francie |
| 2020-01-60 | Predation induces anxiety-like behaviour in crayfish is blocked by pollutants disrupting serotonin pathway | Velká Británie |
| 2020-01-61 | The effect of water oxygen saturation on the performance of pikeperch (Sander lucioperca) in intensive farming | Norsko |
| 2020-01-62 | Antimicrobial peptides in fish seminal plasma and evaluation of their commercial application | Malta |
| 2020-01-63 | PBS analysis in water samples | Rakousko |
| 2020-02-64 | HPLC-MS/MS analysis of pharmaceuticlas and drugs in water samples | Slovensko |
| 2020-02-65 | PBS analysis in water samples | Slovensko |
| 2020-02-66 | Study of shark and skate sperm motility | Španělsko |
| 2020-02-67 | Effect of cryopreservation on lipid composition of sterlet (Acipenser ruthenus) sperm | Česká republika |
| 2020-02-68 | Parentage analysis in sterlet | Česká republika |
| 2020-02-69 | Ploidy level analysis in collected samples of the genus Carassius | Česká republika |
| 2020-02-70 | The effect of oocyte over-ripening on the ocurrence of spontaneous polyploidy in sterlet. | Česká republika |
| 2020-03-71 | Cardiotoxicity of selected pharmaceuticals to early development of nontarget aquatic organisms | Chorvatsko |
| 2020-03-72 | Use of hormonal preparations in artificial spawning of barbel (Barbu Barbus) | Česká republika |
| 2020-03-73 | Does methamphetamine in environmetally relevant concentration affecting ethophysiological parameters of crayfish during early embrional and postembryonal stages | Česká republika |
| 2020-03-74 | The cognitive ability of fish during food intake in a new environment after restocking | Česká republika |
| 2020-03-75 | Population-specific immune response in percid species | Německo |
| 2020-03-76 | Determination of Key Parameters in Fish School Behaviour | Česká republika |
| 2020-03-77 | Carbon quantum dots for fluorescence labeling of cells | Česká republika |
| 2020-03-78 | Measurement of intracellular dynamics after exposition of pesticide | Česká republika |
| 2020-03-80 | Fractionlization of stable isotopes in crayfish body | Itálie |
| 2020-03-81 | The role of predator chemical cues in foraging efficiency and intestinal evacuation of the invasive round goby (Neogobius melanostomus) | Česká republika |
| 2020-03-82 | Estimation of stocking efficiency of the sterlet juveniles in the Slovakian part of the Danube River | Slovensko |
| 2020-03-83 | Visible Aquaphotomics on Mineral Water Concentration | Maďarsko |
| 2020-03-84 | Bacterial community species specificity and dynamics during storage of fish– microbiological and MALDI TOF approach | Česká republika |
| 2020-03-85 | Use of lupine as supplemental feed in carp pond aquaculture | Německo |
| 2020-03-86 | Population-specific stress response in Eurasian perch (Perca fluviatilis) | Česká republika |
| 2020-03-87 | Quantification of selected pharmaceuticals and illicit drugs in extracts from spiders | Švédsko |
| 2020-03-88 | Effect of feed formulation on the diet digestibility and physica properties of feces | Česká republika |
| 2020-04-89 | Description of Cobitis hybrid gametogenesis | Česká republika |
| 2020-04-90 | Analysis of DNA damage repair in non-model fish species | Česká republika |
| 2020-04-91 | AVT correlations with the reproductive condition in male trout | Španělsko |
| 2020-04-92 | Application of nanoparticles for stimulation of spermiation in sterlet | Česká republika |
| 2020-04-93 | Hydrogels in cell cultures | Česká republika |
| 2020-04-94 | Vyhodnocení pokročilé analýzy vzorků vodního prostředí odebraných v souvislosti s rozsáhlou havarijní situací na řece Bečvě za účelem objasnění příčin havárie | Česká republika |
| 2020-04-95 | Fish in RAS biomass estimation using new OAK-D camera | Česká republika |
| 2020-04-96 | Sea bass identification - non-invasive approach | Rakousko |
| 2020-04-97 | Research of herd behaviour of fish in relation to main water contaminants and study of herd behaviour changes ant its aplication for drinking water treatment aparatus. | Česká republika |
| 2019 | ||
| Číslo projektu | Název projektu | Země řešitele |
|---|---|---|
| 2019-01-01 | Analysis of samples from a chronic toxicity test on common carp with synthetic progestins | Česká republika |
| 2019-01-02 | Development of the software for cell migration determinaton | Česká republika |
| 2019-01-03 | Využití recirkulačních systémů při odchovu parmy obecné (Barbus barbus) za účelem zkrácení odchovného cyklu | Česká republika |
| 2019-01-04 | Polarographic assessment of burbot sperm respiration | Česká republika |
| 2019-01-05 | Analysis of RNA localization in vitelogenic zebrafish oocytes | Česká republika |
| 2019-01-06 | Experimental estimation of gut evacuation rates of invasive alien fish and amphipods | Německo |
| 2019-01-07 | Evaluation of cardiac activity and histopathological changes of invasive crayfish under hypoxic conditons | Česká republika |
| 2019-01-08 | Fish sampling in recirculating aquaculture system (RAS) | Česká republika |
| 2019-01-09 | Optimize of the use euryhaline rotifer Brachionus plicatilis for pikeperch Sander lucioperca (L.) larvae first feeding | Česká republika |
| 2019-01-10 | Effects of the sub-optimal water temperatures on the feeding activity of pikeperch (Sander lucioperca) with regards to predator’s sex and size of the prey. | Maďarsko |
| 2019-01-11 | The effect of interspecific competition on the feeding activity of pikeperch (Sander lucioperca) and prey size preference. | Česká republika |
| 2019-01-12 | Use of probiotics for Pikeperch mass production | Česká republika |
| 2019-01-13 | Analýza ploidie a obsahu DNA u potomstva experimentálních populací jeseterů | Česká republika |
| 2019-02-14 | Estimation of the success of gynogenesis by using microsatellite genotyping | Česká republika |
| 2019-02-15 | Ploidy analysis of pikeperch larvae | Maďarsko |
| 2019-02-16 | Behaviour study of sexless Danio | Česká republika |
| 2019-02-17 | Passive sampler permformance evaluation | Česká republika |
| 2019-02-18 | Motility of diplonemids and trypanosomatids | Česká republika |
| 2019-02-19 | Analysis of grab water samples from the catchment of the river Odra | Česká republika |
| 2019-02-20 | Regeneration of pleopods | Itálie |
| 2019-02-21 | Postembryonic development of the freshwater crayfish Austropotamobius torrentium, Cherax destructor and Procambarus virginalis | Česká republika |
| 2019-02-22 | Comparative performance experiment of Silurus glanis strains and families | Estonsko |
| 2019-02-23 | Multiresidual HPLC-MS/MS and in-line SPE-HPLC-MS/MS analysis of drugs, pharmaceuticals and their metabolites in complex environmental samples (waste waters and sludges) | Slovensko |
| 2019-02-24 | Quatification of selected pharmaceuticals in waste water before and after BDD treatment and method development for identification and semi-quantification of degradation/transformation products after BDD treatment | Česká republika |
| 2019-02-25 | Study of pikeperch sperm motility parameters in groups of males with different hormonal stimulation | Česká republika |
| 2019-03-26 | Nutrient and digestaility of seven insect meals used in aquaculture | Česká republika |
| 2019-03-27 | Passive sampler permformance evaluation | Česká republika |
| 2019-03-28 | Evaluation of antiparasitic drugs content in selected fish tissues after treatment | Česká republika |
| 2019-03-29 | Development of aquaponic feed - part 1 digestibility | Německo |
| 2019-03-30 | Development of aquaponic feed - part 2 effect on plant performance | Německo |
| 2019-03-31 | Screening for hot spots of discharging hormonal activities into surface waters and identification of the effect drivers | UK |
| 2019-03-32 | Quatification of selected pharmaceuticals in selected tissues from common carp | Česká republika |
| 2019-03-33 | Quatification of selected pharmaceuticals and illicit drugs in water samples from pond affected by treated waste water | Česká republika |
| 2019-03-34 | The application of immunohistochemical markers on chondrostean and the teleostean tissues | Švýcarsko |
| 2019-03-35 | Hyperspectral imaging and Deep learning algorithms for fillet quality assessment of rainbow trout fed insect proteins | Itále |
| 2019-03-36 | Influence of sperm concentration during freezing on post-thaw outcomes in carp | Brazílie |
| 2019-03-37 | The effect of quinidine on trout sperm motility | Česká republika |
| 2019-03-38 | Evaluation of impact Topmouth gudgeon (Pseudorasbora parva) on zooplankton | Česká republika |
| 2019-03-39 | Parentage assigment of common carp backup stock for selection experiment | Česká republika |
| 2019-03-40 | Quantificaiton of antibiotics from UK rivers | Česká republika |
| 2019-04-41 | Diurnal activity in round goby (Neogobius melanostomus) and European bullhead (Cottus gobio) | Německo |
| 2019-04-42 | Behavioural interactions of invasive round goby (Neogobius melanostomus) and European bullhead (Cottus gobio) | Německo |
| 2019-04-43 | Invasive crayfish resistance to anoxia evaluated by survival duration and cardiac activity | Rumunsko |
| 2019-04-44 | The effects garlic (Allium sativum) powder on growth, digestibility, body composition, immunity factors and stress tolerance in perch (Perca fluviatilis) | Česká republika |
| 2019-04-45 | Characterization of proteome profile of carp (Cyprinus carpio L) semen during refrigerator storage | Česká republika |
| 2019-04-46 | Psychoactive compounds at environmental concentration alter burrowing behavior in the freshwater crayfish | Česká republika |
| 2019-04-47 | Biocompatible electrospun nanofibrous supports for deposition of living cells | Česká republika |
| 2019-04-48 | Behaviour and fitness in cultured Eurasian perch (Perca fluviatilis) - effect of orgin and domestication | Polsko |
| 2019-04-49 | Response of Desmodesmus quadricaudato selected potentially allelopathic componds | Česká republika |
| 2019-04-50 | Dynamic interactions of living cells with the surface of materials | Česká republika |
| 2019-04-51 | Collection of datasets for fish identification in 3D | Česká republika |
| 2019-04-52 | RNA localization in fish embryos | Česká republika |
| 2019-04-53 | Collagen from various mammal species as matrix for tissue engineering | Česká republika |
| 2019-04-54 | Fish skin hyperspektral imagery for diests distinqushing | Česká republika |
