Martin Musil byl od dubna do prosince 2022 členem předsednického týmu, který se zabýval otázkami rybářské politiky EU, jako expert na sladkovodní akvakulturu a rybolov, ochranu vysoce migračních druhů ryb, zejména úhoře a lososa. Práce celého týmu zahrnovala i předsedání pracovní skupině Rady EU a přípravu dalších zasedání, např. pro Výbor stálých zástupců vlád členských států, Radu pro zemědělství a rybolov a další. Kromě toho se zabýval všemi otázkami souvisejícími se Společnou rybářskou politikou, která je založena na udržitelném rybolovu a akvakultuře v EU. Jedním z hlavních výstupů práce celého týmu předsednictví bylo rozdělení a stanovení celkových přípustných odlovů pro různé druhy a populace ryb ve vodách EU nebo vypracování strategických zásad EU pro udržitelnou akvakulturu. Martin se významně podílel na každodenní činnosti Stálého zastoupení ČR při EU, účastnil se velkého množství jednání na mnoha úrovních. Připravoval a plánoval bilaterální jednání mezi jednotlivými členskými státy a předsednickým týmem. Podílel se také na plánování a přípravě podkladů pro tato jednání, zejména se zabýval problematikou úhoře říčního a Baltského moře. Významně přispěl k vytvoření česko-anglicko-latinského slovníku druhů ryb v EU, určeného pro překladatele. Během svého působení v Bruselu se podílel na přípravě a účasti na řadě konferencí o udržitelné akvakultuře, rybolovu a migraci ryb.
