Laboratoř zpracování signálu a obrazu

Hmotnostní spektrometrie:
Dlouhodobý projekt zaštiťující celý tok informací ze samotného měření a informací a znalostí ze získávání dat. Skládá se ze zpracování a analýzy měření z hmotnostní spektrometrie, vývoje, testování a zavádění metod z umělé inteligence.

Projekt nabízí:

• Řešení pro matematický popis modelu, datového souboru, v souladu s teorií měření
• Jednoznačná definice základních pojmů jako je rozlišení, rozlišitelnost, odlišitelnost a přesnost
• Nový přístup k chemické filtraci šumu na základě teorie pravděpodobnosti a digitálního sběru dat
• Dekonvoluce hmotnostních vrcholů a dekompozice chromatografických vrcholů
• Časová korekce, podobnost metriky a faktory spolehlivosti.

Tento projekt byl proveden prostřednictvím spolupráce s Nofima, Norský výzkumný ústav pro výživu, rybolov a akvakulturu a Mikrobiologický ústav AV ČR.

BioWes:
Projekt je zaměřen na vytvoření systému pro management experimentálních dat a metadat. Jedná se o komplexní řešení od návrhu protokolu experimentu, přes realizaci experimentu až po sdílení a vyhledávání dat

Základní funkcionalita systému:

• Lokální úložiště dat – data + metadata
• Podpora libovolného formátu dat
• Elektronický protokol experimentu – znovu využitelnost
• Přímé propojení experimentálních dat a popisu experimentu
• Podpora standardizací (Bioportal)
• Automatické získávání dat o nastavení přístrojů
• Jednoduchý systém sdílení
• Vyhledávání v metadatech experimentů
• Specializované zásuvné moduly pro zpracování specifických dat

Testovací verze systému je dostupná na stránkách projektu www.biowes.org

Tento projekt byl proveden prostřednictvím spolupráce s DataPartner, Videňskou univerzitou a Aquaexcel konsorcia.

Biomonitoring:
Tento projekt je zaměřen na sledování kvality vody na základě ryb a raků a vývoje systémů pro zachycení pohybujících se rybích hejn a jejich analýzu:

• monitoring srdeční činnosti raků
• sledování pohybu rybích hejn a raků.
• Záznam 24h/den.

Tento projekt byl proveden prostřednictvím spolupráce s Nofima, Norský výzkumný ústav pro výživu, rybolov a akvakulturu, Jihočeské výzkumné centrum akvakultury a biodiversity hydrocenóz, Laboratoř etologie ryb a raků, FROV, Jihočeská univerzita a konsorcia Aquaexcel.

Zpracování obrazu
Široká doplňková dílčí témata v rámci řešení úloh zpracování a analýzy obrazu jsou:

• Ryby a mořští koníci – vyhodnocení změny barvy.
• Segmentace obrázků z fluorescenční mikroskopie.
• Subtraktivní zobrazování v konfokální fluorescenční mikroskopii.
• Registrace obrazu.

Tento projekt byl proveden za spolupráce s Vídeňskou univerzitou, Mikrobiologickým Institutem ASCR, Univerzity Las Palmas, a Ústavem komplexních systémů.

Digitální kalibrace
Tento dlouhodobý menší projekt je zaměřen na testování a kalibraci digitálních zařízení:

• Barevná reprezentace.
• Rozlišení, rozlišitelnost, odlišitelnost.
• Hloubka bitu, vzorkování, kvantování.
• Formátování obrazu.