FROV

GABČÍKOVO, August 15, 2024 - What is the current state of fish stocks in the Slovak part of the Old Danube? This is what experts on freshwater ecosystems have been finding out in 13 sections of the main river and its system of side branches. The extensive ichthyomonitoring was carried out during the week of 4 to 9 August 2024 by an experienced team from the Faculty of Fisheries and Water Conservation of the University of Bořek Drozd in České Budějovice as part of the LIFE Living Rivers project (101069837/LIFE21-IPE-SK-Living-Rivers).

In addition to the main coordinator of the activity, other project partners and representatives of stakeholder groups such as the Slovak State Nature Conservation Agency, the Slovak Ministry of the Environment, the Research Institute of Water Management, WWF Slovakia and the Slovak Fishermen's Association participated in the monitoring.

What the waters of the Danube have revealed?

The findings of experts after a week of intensive work on Slovakia's largest river, specifically in its original inland delta, are unfortunately not very encouraging. "The old Danube has extremely little water, as most of it is diverted near Bratislava into the inflow channel of the Gabcikovo hydroelectric power plant. We have seen huge amounts of silt and sediment that should not be there at all. Already today, the Old Danube is becoming uninhabitable for many native Danube fish species. Unless the situation changes and more water is added to the river, this typical Danube habitat will disappear completely," warns fish ecologist Bořek Drozd with concern. According to him, this situation has a major negative impact on life below the surface. Things are not looking good for fish populations on the Slovak section of the Danube. Although the representation of species is relatively stable, their populations have declined significantly in recent years.

According to the experts, although the Old Danube river system is full of common carp species, the rheophilic, i.e. stream-loving, fish species have declined extremely. Some of the original groups, such as sturgeons, an iconic group of fish more than 200 million years old, have virtually disappeared from the Old Danube due to poor living conditions. "This is the result of a combination of the impacts of construction and inadequate management of the operation of the Gabčíkovo system of water canals, which in the unique ecosystem of the Old Danube are manifested by water scarcity, poor flow conditions, overheating of the water and intense sedimentation. This impact is further compounded by global climate change. As a result, the sad fact is that the once unique ecosystem of the inland Danube Delta is gradually becoming uninhabitable for most native fish species and is de facto gradually disappearing physically," says Bořek Drozd. He says it is paradoxical that Slovakia has committed to achieving the so-called good ecological status of the Old Danube by 2027, as required by the Water Framework Directive - an extremely difficult race against time.

During the August monitoring, both day and night catches were made and all fish caught were counted, measured, weighed and then returned to the water. Both common and rarer fish species were documented. Among the rarer ones, there were e.g. the greater spotted seatrout, yellow sturgeon, curved-spotted spurdog, Vladykov's roach, Danube roach (glossy), but also other rheophilic species or species of European importance.

The situation is also complicated by the non-native inhabitants of the Danube

A separate chapter is the spread of fish that have no business in the Danube. And ichthyologists have found many of them during monitoring. "The situation is also made more difficult by the spread of so-called invasive fish species, especially the white tolstolobik, which seriously threatens native species," adds Bořek Drozd's colleague Martin Šindler. The large distribution of this carp-like fish in Danube waters was also confirmed by monitoring in August. According to experts, this originally Asian fish has apparently started to reproduce spontaneously in the Danube and has essentially flooded the main stream. This can be observed, for example, at sites near Komárno, where tolstolobics, spooked by the sound of boat engines, jump into people's boats.

Other invasive species, such as the Danube snapper, are also a problem for the Danube. According to Bořek Drozd, the native common bream has also almost completely disappeared from the river system, replaced by the non-native, highly invasive silver bream.

Future prospects

Monitoring, which is part of the LIFE Living Rivers project, has been carried out regularly on this section of the Danube since 2023, twice a year, as well as at other sites. The main objective is to obtain the data needed to design appropriate measures to make the Gabčíkovo and Čunovo reservoirs passable and to restore regular fish migrations. Experts hope that the results of this monitoring will serve as a basis for effective measures to protect and restore fish populations in this important European river.

At the same time, the Faculty of Fisheries and Water Conservation of the University of Gdańsk is carrying out telemetric monitoring of small sturgeons on the Danube, which are considered to be the flagship species for the river basin. This means that if this rheophilic species can be maintained and preserved, other fish species will also thrive in the Danube waters and human society will also benefit.

"A functioning ecosystem means not only high water quality, but also effective flood protection, a more stable climate, sufficient water in times of drought, a source of crops and food, recreational activities, high species richness of flora and fauna,... In short, the Old Danube has a lot to offer us if we finally start to take good care of it. But we don't have much time left," concludes Bořek Drozd.

About the LIFE Living Rivers project

LIFE Living Rivers is a joint project of ten institutions and organisations focused on the implementation of the Slovak Water Plan in the Danube, Hron, Ipeľ and Bělá river basins. The aim of the partner organisations is to ensure a good ecological state of water and thus improve a total of 344 kilometres of our rivers.

Project partners:

Výskumný ústav vodného hospodárstva (VÚVH), Ministerstvo životného prostredia Slovenskej republiky (MŽP), Slovenský vodohospodársky podnik, š. p. Štátna ochrana prírody Slovenskej republiky (ŠOP SR), Bratislavské regionálne ochranárske združenie (BROZ), WWF Slovensko, Catch Me If You Can, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Správa Tatranského národného parku (TANAP), Vodohospodárska výstavba, š. p.

For more information on the LIFE Living Rivers project, click here.

Articles related to LIFE Living Rivers:

Co-funded by the European Union. Views and opinions expressed are however those of the author(s) only and do not necessarily reflect those of the European Union or CINEA. Neither the European Union nor the granting authority can be held responsible for them.

A team of scientists from the Faculty of Fisheries and Water Conservation of the University of South Bohemia monitored the current status of fish populations in 13 sections of the main river Danube and its side branches from 4 to 9 August 2024. Read more about the extensive ichthyomonitoring within the LIFE Living Rivers project (101069837/LIFE21-IPE-SK-Living Rivers) zde.

Co-funded by the European Union. Views and opinions expressed are however those of the author(s) only and do not necessarily reflect those of the European Union or CINEA. Neither the European Union nor the granting authority can be held responsible for them.

On 30 May 2025, the third meeting of the Council for Commercialization and Social Relevance (CCSR) took place at the Faculty of Fisheries and Protection of Waters of the University of South Bohemia in České Budějovice (FFPW USB).

The opening speech was given by the Dean of the Faculty, Prof. Tomáš Policar, Ph.D., who presented the current state of the faculty, its main directions of research, university teaching, development of cooperation with production enterprises and visions for the future, which concern the social relevance of the faculty. He presented the activities of all key components of the Faculty: the Research Institute of Fish Culture and Hydrobiology (RIFCH), the Institute of Aquaculture and Protection of Waters (IAPW), the South Bohemian Research Center of Aquaculture and Biodiversity of Hydrocenoses CENAKVA and the International Environmental Educational, Advisory and Information Centre of Water Protection (IEEAIC / MEVPIS).

Special attention was also paid to the area of commercialization, which is an important part of the social relevance of the faculty. The topic was approached by Ing. Václav Nebeský, Ph.D., who presented the practical outputs of the faculty in this area. Significant activities include, for example, the sale of Omega3 carp to the MAKRO supermarket chain, the supply of faculty fish products to the Slevomat platform, or the development and sale of unique cosmetics based on gently sourced sturgeon caviar (Sturgeon Friendly Caviar).

This was followed by thematic presentations focusing on specific achievements and activities within individual research areas:

Prof. Vladimír Žlábek, Ph.D. - introduced the South Bohemian Research Centre for Aquaculture and Biodiversity of Hydrocenoses CENAKVA as an open research centre providing scientific, service and educational services in the field of fisheries and water conservation to partners from all over the world.

Assoc. Prof. Jan Mráz, Ph.D. - presented company-wide and commercial activities in the field of aquaculture and fish processing.

Assoc. Prof. Martin Kocour, Ph.D. - presented technological innovations and practical applications in the field of fish reproduction and breeding.

Assoc. Prof. Hana Kocour Kroupová, Ph.D. - spoke about research and application activities focused on the protection of the aquatic environment.

During the CCSR meeting, there was also an expert discussion on further possibilities of developing commercialization and strengthening the social relevance of the FFPW USB.

The final part of the CCSR meeting offered the participants refreshments in the form of a buffet with tasting of fish specialties from the production of the faculty processing plant and the ‘Fish for Health’ shop.

The 3^rd meeting of the Commercialization and Social Relevance Council of the FFPW USB was held in a very inspiring atmosphere and provided a valuable space for sharing knowledge, experience and suggestions for further development and cooperation among all participants. 

At the end of the meeting, the Council members had the opportunity to participate in a guided tour of selected operational and experimental sites of the FFPW USB and CENAKVA, including the Laboratory of Environmental Chemistry and Biochemistry, the Genetic Fisheries Center and the Experimental Fish Culture Facility.

Another TNA project within the Aquaexcel3.0 has been implemented at the FFPW USB.

The lead researcher is Dr. Uroš Ljubobratović from the Hungarian University of Agriculture and Life Sciences (MATE).

Dr. Ljubobratović succeeded with the project called “The effect of pikeperch (Sandr lucioperca) broodstock origin on their ability to express natural reproductive behaviour”. The responsible researcher for the FFPW USB is MSc. Oleksandr Malinovskyi, Ph.D.

Dr. Ljubobratović is spending this week in the Laboratory of Intensive Aquaculture in Vodnany where he implements an experiment on the biology of pikeperch reproduction and the influence of the broodstock origin on their reproductive abilities.

The access is free of charge. The AE3.0 project will pay for the experimental costs as well as the travel and subsistence costs.

The TNA call is continuous so you can apply for access to 40 partners´ installations at any time within the duration of the AE3.0 project. More information at the project website.

This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under grant agreement No. 871108 (AQUAEXCEL3.0). This output reflects only the author’s view and the European Commission cannot be held responsible for any use that may be made of the information contained therein.

Aquaponics is a sustainable food production system that uses nutrient-rich wastes from aquaculture to produce vegetables in hydroponic systems. The nutrients locked in the wastes are converted into absorbable forms for plant use by beneficial microbes present in the cultivation loops. These microbes are also responsible for other biological processes, such as methanogenesis and sulphate reduction, and they contribute to reduced susceptibility to diseases. Dr. Zala Schmautz from the Zurich University of Applied Sciences in Switzerland and Dr. Ewumi Azeez Folorunso from the Laboratory of Nutrition at FFPW USB have completed a TNA that investigated the impact of plant species and cropping systems on the abundance, diversity, and metagenomes of microbial consortia in aquaponic and hydroponic systems. As seen in field studies, plant species are major determinants in the types of microbial communities found in soil rhizobiomes and rhizoplanes(Anthony et al., 2020; Nkongolo & Narendrula-Kotha, 2020). Incessant successes in understanding this natural selection have yielded established sustainable cultivation approaches, such as cereal-legume intercropping, which increases protein yield and reduces the need for nitrogen fertilization.

On the other hand, there is little to no information on the impact of plant species or cropping systems on microbial consortia in soilless systems, such as aquaponics and hydroponics(Schmautz et al., 2022). Understanding the impact of these variables will not only help optimize these systems but also provide a new dimension for addressing challenges such as pests, diseases, and nutrient dynamics in cultivation systems(Folorunso et al., 2021). A strong indication of the impact of plant species and cropping systems on microbial diversity is nutrient uptake by plants in the cultivation systems. For example, iron and nitrogen uptake in plants are products of siderophore activity and nitrification, both of which are biological processes dictated by the present microbial communities in the cultivation systems. In the preliminary results of our study, we have identified significant differences in the uptake of Fe and total nitrogen (among other nutrients) in hydroponics and aquaponics, as well as between basil and lettuce (Figure 1). This may indicate discrepancies in the microbiome across the two cultivation systems and plant species in the expected result of the metagenome. The metagenome result is expected to provide a benchmark for the characterization of microbial communities across the two systems and plant species, and the further manipulation to tackle existing challenges in soilless production systems.

Link to the video.

References

Anthony, M. A., Crowther, T. W., Maynard, D. S., van den Hoogen, J., & Averill, C. (2020). Distinct assembly processes and microbial communities constrain soil organic carbon formation. One Earth, 2(4), 349–360. https://www.cell.com/one-earth/pdf/S2590-3322(20)30142-1.pdf

Folorunso, E. A., Roy, K., Gebauer, R., Bohatá, A., & Mraz, J. (2021). Integrated pest and disease management in aquaponics: A metadata-based review. Reviews in Aquaculture, 13(2), 971–995. https://doi.org/10.1111/raq.12508

Nkongolo, K. K., & Narendrula-Kotha, R. (2020). Advances in monitoring soil microbial community dynamic and function. Journal of Applied Genetics, 61(2), 249–263. https://doi.org/10.1007/s13353-020-00549-5

Schmautz, Z., Walser, J.-C., Espinal, C. A., Gartmann, F., Scott, B., Pothier, J. F., Frossard, E., Junge, R., & Smits, T. H. M. (2022). Microbial diversity across compartments in an aquaponic system and its connection to the nitrogen cycle. Science of The Total Environment, 852, 158426. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.158426

Na Fakultě rybářství a ochrany vod JU je realizován další TNA projekt v rámci Aquaexcel3.0.

Hlavním řešitelem je Dr. Uroš Ljubobratović z Maďarské univerzity zemědělství a přírodních věd.

Dr. Ljubobratović uspěl s projektem nazvaným „The effect of pikeperch (Sandr lucioperca) broodstock origin on their ability to express natural reproductive behaviour“. Odpovědným řešitelem za FROV JU je MSc. Oleksandr Malinovskyi, Ph.D.

Dr. Ljubobratović tráví tento týden v Laboratoři intenzivní akvakultury ve Vodňanech a realizuje experiment související s biologií reprodukce candáta a vlivem původu generačních ryb na jejich reprodukční schopnosti.

TNA přístup je bezplatný. Projekt AE3.0 hradí náklady na vedení experimentu vč. cestovních a pobytových výdajů.

Výzva TNA je nepřetržitá, tudíž můžete kdykoli během trvání projektu AE3.0 požádat o přístup ke 40 instalacím partnerů. Více informací na webu projektu.

This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under grant agreement No. 871108 (AQUAEXCEL3.0). This output reflects only the author’s view and the European Commission cannot be held responsible for any use that may be made of the information contained therein.

Je aktivní a ostražitá, ale překonání některých bariér je nad její síly. Parma obecná (Barbus barbus) je jedním z původních obyvatel našich řek. Tato ryba, stejně jako jeseteři a boleni, potřebuje ke svému životu a rozmnožování volný pohyb ve vodě. Migrační bariéry, v podobě přehrad, hrází a dalších betonových staveb na vodních tocích, však ztěžují její přirozený pohyb v řekách.

Parma obecná je ryba, která se během svého života pohybuje v různých částech řeky, aby našla vhodné podmínky pro rozmnožování, růst nebo zimování. Migrační trasy, které k tomu využívá, jsou bohužel stále více blokovány. Jen na Slovensku protíná řeky téměř 1 500 známých bariér, z nichž až 80 % brání rybám v migraci. To má za následek pokles početnosti parmy obecné a dalších původních druhů ryb, jakož i celkové narušení ekosystémů řek.

Telemetrické sledování jako nástroj ochrany

V rámci projektu LIFE Living Rivers probíhají důležité aktivity na čtyřech slovenských řekách. Jednou z nich je Dunaj, v jehož vodách odborníci sledují pohyb několika původních druhů ryb, včetně parmy obecné.

V dubnu 2024 byl na 97kilometrovém úseku Dunaje zahájen telemetrický monitoring, který provádí výzkumný tým z Fakulty rybářství a ochrany vod Jihočeské univerzity (FROV JU) pod vedením Dr. Bořka Drozdav koordinaci se Slovenským rybářským svazem. Zatímco v počáteční fázi se vědci zaměřili především na monitoring jeseterů malých, nyní přišla na řadu i parma obecná. Koncem října odborníci vylovili z dunajských vod 50 exemplářů, kterým veterinář implantoval malé vysílačky. Ryby byly poté vypuštěny zpět do Dunaje.

Telemetrická zařízení umožní odborníkům sledovat další cestu parmy řekou. Kromě toho, že vědcům poskytnou cenné informace o jejich poloze, dokonce i o teplotě nebo hloubce vody, ve které plavou, pomohou jim také odhalit problematické úseky Dunaje a určit migrační překážky, které nejvíce znepříjemňují jejich život. Výsledky výzkumu také pomohou při přípravě vhodných opatření, která by měla zprůchodnit vodní stavby, jež rybám brání v migraci.

Budoucnost řek a parmy obecné

Zdravé a tekoucí řeky jsou nedílnou součástí našeho životního prostředí a krajiny, kterou sdílíme. Kromě toho poskytují útočiště mnoha živočichům nejen pod vodní hladinou, ale i ve svém okolí. Ochrana parmy obecné a dalších druhů ryb je důležitým krokem k podpoře biologické rozmanitosti a stability našich vodních ekosystémů. Projekt LIFE Living Rivers počítá s obnovou migračních koridorů, které umožní rybám volný pohyb řekami, aby mohly plnit svou úlohu v sladkovodních ekosystémech.

Pokud se podaří zlepšit podmínky pro migraci ryb, bude to úspěch nejen pro samotné ryby, ale také pro celá říční společenstva, která jsou nedílnou součástí naší přírody.

Více informací o projektu najdete zde a zde.

Vzrušující zprávy z našeho nejnovějšího výzkumu o rybnících a rybách!

Zjistili jsme, že přirozená potrava a ekosystém rybníka mohou pomoci kaprům lépe trávit přijatou potravu. To znamená, že plankton a prostředí rybníka společně pomáhají rozkládat těžko stravitelné složky potravy, jako je celulóza, chitin a fosfor (fytát) v žaludku ryb.

Zajímavé je, že během období, kdy je voda čistá, s nízkým obsahem řas, ale s množstvím drobného zooplanktonu, se trávení kaprů ještě zlepšuje. Tento objev by nám mohl pomoci efektivněji obhospodařovat naše rybníky.

Tento efekt s názvem „synergický efekt stravitelnosti“ byl teoreticky popsán v našem předchozím článku (2022) a ověřen v recentní studii (2024).

Více informací o tom, jak může tento poznatek revolucionalizovat náš přístup ke krmení v rybnících lze najít v následující publikaci:

Roy, K., Kajgrova, L., Capkova, L., Zabransky, L., Petraskova, E., Dvorak, P., Nahlik, V., Kuebutornye, F.K.A., Blabolil, P., Blaha, M., Vrba, J., and Mraz, J. 2024. Synergistic digestibility effect by planktonic natural food and habitat renders high digestion efficiency in agastric aquatic consumers. Science of the Total Environment, 927, 172105.

Tato studie byla podpořena Grantovou agenturou České republiky, projekt:GAČR 22-18597S.

Napsal: Koushik Roy, Ph.D. Grafický abstrakt: BioRender (licence JA26MXISBO)

Dne 28. března 2025 předal, děkan Fakulty rybářství a ochrany vod JU prof. Tomáš Policar, certifikáty a smlouvy hlavním řešitelům vítězných projektů, které mají přispět k podpoře udržitelnosti rybářství a ochraně přírody, krajiny a vod.

Vítězné projekty:

• Jakub Kocour – Poznej svého nepřítele aneb jak eDNA pomáhá chránit původní druhy raků
• Abdul Baten – Zlepšení výživy dětí nebo více nezdravých rybích produktů? Vyhodnocení rybích pokrmů ze školní jídelny ve světle nové legislativy
• Tomáš Pěnka – Inovativní využití kalového odpadu z akvakultury: Chov hmyzu jako krmiva pro ryby
• Barbora Zdvihalová – Vylepšení technologie pro odstranění dusíku z odpadních vod: ověření účinnosti specifického mikrobiálního konsorcia pro nitrifikaci a denitrifikaci

Projekty se umístily v tomto pořadí.

V průběhu setkání prezentovali studenti hlavní zaměření a cíle svých projektů. V rámci jednotlivých projektů vzniknou odborně-popularizační materiály formou krátkých videí či letáku a závěrečné zprávy.

Finanční podporu studentských projektů poskytla ČSOB, a.s. a studenti ji mohou začít čerpat od 1. dubna 2025.

Fakulta rybářství a ochrany vod JU se jako tradiční spoluorganizátor zúčastnila 32. ročníku Vodňanských rybářských dnů (16.–18. 5. 2023) a nabídla návštěvníkům pestrý a bohatý program. Kromě živých ryb, raků a dalších vodních organismů se mohli návštěvníci dozvědět vše o probíhajícím výzkumu, tématech, kterými se místní vědci zabývají a také si prohlédnout špičkově vybavené laboratoře. Jednou z „výstavních skříní“ fakulty je Laboratoř environmentální chemie a biochemie, kde mohli lidé též diskutovat o tématech souvisejících s kvalitou povrchové, podzemní nebo pitné vody a jejich ochranou. Děti si pak mohly vyzkoušet měření pH, výrobu chromatografických motýlků nebo filtrování znečištěné vody.

V dalších laboratořích lidé zhlédli interaktivní představení procesu kryokonzervace (zmrazování buněk a tkání při teplotě tekutého dusíku -192°C) nebo pozorovali videozáznamy motility spermií různých druhů ryb s odlišnou reprodukční strategií. Mohli si také zkusit odhadnout, ke kterému druhu patří jikry, nebo pozorovat různé preparáty pod mikroskopem. V prostorách Genetického rybářského centra byli k vidění jeseteři ve stádiích od rozkrmeného plůdku až po generační hejna vybraných druhů těchto prehistorických chrupavčitých ryb. Zájem vzbudily živé jikry kapra těsně před vykulením nebo kapří rozplavaný plůdek. Na vodňanském náměstí nechyběl fakultní stánek, v němž mohli lidé ochutnat rozličné produkty akvakultury.

Bohatý program byl připravený také v environmentálním centru (MEVPIS Vodňany), před nímž zakotvila mobilní laboratoř Biologického centra Akademie věd ČR, kde vědci mimo jiné představili výzkum pstruhů v rámci projektu „Živé klenoty pod vodní hladinou Šumavy“. Vedle toho centrum hostilo organizaci Kraken, která pro děti a dospělé připravila spoustu deskových her, jež si mohli zájemci přímo na místě vyzkoušet.

Autor: Miroslav Boček

Autorka fotografií: Dana Brožová

Fakulta rybářství a ochrany vod JU se již tradičně podílela na 33. ročníku Vodňanských rybářských dnů ve dnech 15.–17. 5. 2025a nabídla návštěvníkům pestrý program. Kromě ukázky živých ryb a raků otevřela fakulta návštěvníkům špičkově vybavené vědecké laboratoře a rybochovná pracoviště, kde se mohli seznámit s aktuálním výzkumem a tématy, jimiž se vědci naší fakulty zabývají.

Laboratoř environmentální chemie a biochemie prezentovala témata související s kvalitou povrchové, podzemní nebo pitné vody a jejich ochranou. Děti si v rámci interaktivních aktivit mohly vyzkoušet měření pH, výrobu chromatografických motýlků nebo filtrování znečištěné vody, čímž byl vzdělávací obsah zpřístupněn i nejmladším návštěvníkům.

V Laboratoři fyziologie reprodukce byl pro návštěvníky připraven naučný kvíz, při kterém si mohli otestovat znalosti druhů ryb a jejich jiker. Součástí programu byla také interaktivní ukázka procesu kryokonzervace (zmrazování buněk a tkání při teplotě tekutého dusíku –192 °C), pozorování různých preparátů pod mikroskopem či pozorování motility spermií různých druhů ryb s odlišnou reprodukční strategií.

Genetické rybářské centrum umožnilo návštěvníkům nahlédnout do fascinujícího světa rybích embryí, včetně prezentace unikátních druhů schopných přežít i mimo vodní prostředí.

Mezinárodní Environmentální Vzdělávací, Poradenské a Informační Středisko (MEVPIS) Vodňany připravilo populárně-naučné programy zaměřené na klimatické změny, které byly určeny především pro základní školy. Centrum dále hostilo organizaci Vodňanský deskoherní klub Kraken, která pro děti i dospělé zajistila širokou nabídku deskových her k okamžitému vyzkoušení. Připraveny byly i výtvarné aktivity a robotické pexeso.

V prostorách MEVPISu, ve venkovním pavilonu, byla rovněž instalována výstava „Fotografického atlasu rostlin České republiky", jehož vznik podporuje děkan fakulty Prof. Tomáš Policar. Pro rodiny s dětmi byla připravena stanoviště s omalovánkami a dalšími tvořivými aktivitami, mikroskopy, botanický kvíz a doplňkové edukační prvky, které umožnily aktivní zapojení všech věkových kategorií.

Během 33. ročníku Vodňanských rybářských navštívila naši fakultu necelá tisícovka návštěvníků, kterým děkujeme za účast.

Děkujeme také všem, kteří se podíleli na přípravě letošního ročníku.

Foto: web města Vodňany, autor: Karel Burda

The Faculty of Fisheries and Protection of Waters USB has traditionally participated in the 33^rd annual Vodňany Fishing Days on 15-17 May 2025 and offered visitors a varied programme. In addition to live fish and crayfish demonstrations, the faculty opened to the visitors the state-of-the-art scientific laboratories and fish farming workplaces, where they could learn about the current research and topics that the scientists of our faculty deal with.

The Laboratory of Environmental Chemistry and Biochemistry presented topics related to surface, groundwater or drinking water quality and protection. Children were able to try out pH measurements, making chromatographic butterflies or filtering polluted water as part of interactive activities, making the educational content accessible even to the youngest visitors.

In the Laboratory of Reproductive Physiology, an educational quiz was prepared for visitors to test their knowledge of fish species and their eggs. The programme also included an interactive demonstration of the cryopreservation process (freezing of cells and tissues at a liquid nitrogen temperature of -192 °C), observation of various specimens under a microscope and observation of sperm motility of different fish species with different reproductive strategies.

The Genetic Fisheries Center gave visitors a glimpse into the fascinating world of fish embryos, including the presentation of unique species able to survive outside the aquatic environment.

The International Environmental Educational, Advisory and Information Centre of Water Protection (IEEAIC / MEVPIS) Vodňany prepared popular educational programmes focused on climate change, which were intended mainly for primary schools. The Centre also hosted the Vodňany Kraken Board Game Club, which provided a wide range of board games for children and adults to try out. There were also art activities and a robotic memory game.

In the IEEAIC / MEVPIS premises, in the outdoor pavilion, there was also an exhibition of the "Photographic Atlas of Plants of the Czech Republic", whose creation is supported by the Dean of the Faculty, Prof. Tomáš Policar. For families with children, there were stations with colouring books and other creative activities, microscopes, a botanical quiz and additional educational elements that allowed active participation of all ages.

During the 33^rd edition of the Vodňany Fishing Festival, nearly a thousand visitors visited our faculty and we thank them for their participation.

We would also like to thank everyone who participated in the preparation of this year's event.

Photo: website of the town of Vodňany, author: Karel Burda

Více než stovku kusů kriticky ohroženého raka říčního a zhruba 300 jedinců karase obecného, který je na červeném seznamu ohrožených druhů, vysadili vědci z Fakulty rybářství a ochrany vod Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích do rybníku Na Flekačkách v Semicích u Písku.

„Tento záchranný program umožňuje vytváření nových lokalit na ochranu genofondu raků říčních, a tím ochranu vybraných populací do budoucna. Má mimo jiné za cíl uchovat původní populaci raka říčního ohroženou račím morem a invazivními druhy raků,“ uvedl Jan Kubec z Fakulty rybářství a ochrany vod.

Zároveň s raky vědci do rybníka Na Flekačkách vysadili několik stovek kusů karase obecného. Jedná se o původní druh ryby, která je podobně jako rak říční ohrožena invazivními druhy. Karase obecného, původně běžného obyvatele tuzemských vod, vytlačily především intenzivní druhy ryb, a to zejména karas stříbřitý a střevlička východní.

Invazní druhy ryb a raků ohrožují původní populace svou agresivitou a přenosem račího moru. Proto odborníci z odboru životního prostředí ve spolupráci s fakultou hledají další vhodné lokality pro jejich ochranu. Jednou z nich je rybník Na Flekačkách, který se stal součástí programu druhové ochrany. Mezi další zapojené lokality na Písecku patří například rybníky Šácha, Nový, Pod Vojtíškem nebo U Sudu.

U zrodu celého programu druhové ochrany raků říčních stál nynější rektor Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích Pavel Kozák, který se problematice ochrany a reintrodukce raků na Písecku věnuje dlouhodobě.

Původní znění článku zde.

Rozhovor rektora JU Pavla Kozáka pro Český rozhlas Plus na 17. minutě zde.

Foto: jcted.cz

Akvaponie je udržitelný systém produkce potravin, který využívá odpady bohaté na živiny z akvakultury k produkci zeleniny v hydroponických systémech. Živiny z akvakulturních odpadů jsou přeměněny na vstřebatelné formy pro rostlinné využití prospěšnými mikroorganismy přítomnými v kultivačních jednotkách. Tyto mikroorganismy jsou také zodpovědné za další biologické procesy, jako je metanogeneze a redukce síranů, a přispívají ke snížení náchylnosti k nemocem. Dr. Zala Schmautz z Zurich University of Applied Sciences ve Švýcarsku a Dr. Ewumi Azeez Folorunso z Laboratoře výživy na FROV JU dokončili projekt, který zkoumal vliv rostlinných druhů a pěstebních systémů na početnost, diverzitu a metagenomy mikroorganismů v akvaponických a hydroponických systémech. Jak je vidět v terénních studiích, rostlinné druhy jsou hlavními determinanty typů mikrobiálních společenstev nalezených v půdních rhizobiomech (Anthony et al., 2020; Nkongolo & Narendrula-Kotha, 2020). Početné výzkumy věnované pochopení tohoto přirozeného výběru přinesly zavedené přístupy udržitelného pěstování, jako např. meziplodiny obilnin a luštěnin, které zvyšují výnos bílkovin a snižují potřebu hnojení dusíkem.

Na druhé straně existuje jen málo informací o vlivu rostlinných druhů nebo systémů pěstování na mikrobiální konsorcia v systémech bez půdy, jako je akvaponie a hydroponie (Schmautz et al., 2022). Pochopení dopadu těchto proměnných pomůže nejen optimalizovat tyto systémy, ale také poskytne nový rozměr pro řešení problémů, jako jsou škůdci, choroby a dynamika živin v pěstebních systémech (Folorunso et al., 2021). Silným ukazatelem vlivu rostlinných druhů a pěstebních systémů na mikrobiální diverzitu je příjem živin rostlinami v pěstebních systémech. Například příjem železa a dusíku v rostlinách jsou produkty aktivity sideroforů a nitrifikace, což jsou oba biologické procesy diktované současnými mikrobiálními komunitami v kultivačních systémech. V předběžných výsledcích naší studie jsme identifikovali významné rozdíly v příjmu železa a celkového dusíku (mimo jiných živin) v hydroponii a akvaponii, stejně jako mezi bazalkou a salátem (obrázek 1). To může naznačovat nesrovnalosti v mikrobiomu napříč dvěma kultivačními systémy a rostlinnými druhy v očekávaném výsledku metagenomu. Očekává se, že výsledek metagenomu poskytne měřítko pro charakterizaci mikrobiálních společenstev napříč dvěma systémy a rostlinnými druhy a další manipulaci k řešení stávajících problémů v systémech produkce bez půdy.

Odkaz na video.

Literární zdroje

Anthony, M. A., Crowther, T. W., Maynard, D. S., van den Hoogen, J., & Averill, C. (2020). Distinct assembly processes and microbial communities constrain soil organic carbon formation. One Earth, 2(4), 349–360. https://www.cell.com/one-earth/pdf/S2590-3322(20)30142-1.pdf

Folorunso, E. A., Roy, K., Gebauer, R., Bohatá, A., & Mraz, J. (2021). Integrated pest and disease management in aquaponics: A metadata-based review. Reviews in Aquaculture, 13(2), 971–995. https://doi.org/10.1111/raq.12508

Nkongolo, K. K., & Narendrula-Kotha, R. (2020). Advances in monitoring soil microbial community dynamic and function. Journal of Applied Genetics, 61(2), 249–263. https://doi.org/10.1007/s13353-020-00549-5

Schmautz, Z., Walser, J.-C., Espinal, C. A., Gartmann, F., Scott, B., Pothier, J. F., Frossard, E., Junge, R., & Smits, T. H. M. (2022). Microbial diversity across compartments in an aquaponic system and its connection to the nitrogen cycle. Science of The Total Environment, 852, 158426. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2022.158426

An innovative system for monitoring fish migration has been installed at the St. Wenceslas Dam on the Otava River in Písek. This pilot project, implemented by the Faculty of Fisheries and Protection of Waters at the University of South Bohemia in České Budějovice (FFPW USB), is the first of its kind in the Czech Republic and will provide valuable data on the functionality of fish passes.

Although the law obliges to build fish passes, their actual effectiveness is not commonly monitored. The aim of this project is to evaluate which fish species use the crossing and in what quantities, which will help to better understand fish migration and improve the future construction of these facilities.

How does the system work?

The system uses special camera technology with machine learning features to automatically identify the species and number of migrating fish. A camera placed in the water captures the fish using line scanning, based on which the software reconstructs the silhouette of the fish and identifies it.

Importance for science and fisheries

This project brings new opportunities not only for research on fish migration, but also for ecosystem protection and fisheries management. The Faculty works closely with the Czech Fishermen's Association and the data obtained can help in the fight against invasive species and the protection of endangered fish.

Long-term research and next steps

The Faculty of Fisheries and Protection of Waters USB will continuously test the system and analyse the collected data. The research is funded by the Czech Technology Agency project focused on fish migration analysis and invasive species control.

Important notice

To protect the monitored reach, movement in the fish passage is prohibited. Fishermen must keep a minimum distance of 50 meters from the crossing.

This project demonstrates that the Faculty of Fisheries and Protection of Waters USB is a pioneer in applied research on fish migration and contributes to more effective management of watercourses in the country.

More details about the project can be found in a report on Kurýr TV, Český rozhlasand Česká televize (18:47).

At the IEEAIC (MEVPIS) we celebrated World Water Day, which falls on 21^st March every year. This year's theme was The Secret Life of Glaciers.

Children and adults could see information panels about the origin of glaciers, their importance for the whole planet and ways to protect them. The programme also included a theatre performance Frutti di mare performed by Anička a letadýlko. A great interest was aroused by chemical experiments with dry ice, which were presented by an experienced lecturer Miroslav Boček.
The creative part of the programme was taken care of by art teacher and photographer Gabriela Valentová, with whom the children could make penguins from egg shells, polystyrene icebergs or polar bears.

Refreshments during the event were provided by the U Lípy Café and Tea Room.

Thank you to all the staff and friendly organisations for their help with the preparation and implementation of the event and to all the visitors - approximately 180 children and adults came to celebrate Water Day!

Video of the event can be found on the faculty Instagram.

On 3 and 4 June 2025, the state final examinations (SFE) and defences of bachelor theses of students of the bachelor study programmes Fisheries or Water Protection took place at FROV JU. 8 students in the bachelor's study programme Fisheries successfully completed and defended their bachelor's thesis, 1 student in the study programme Water Protection.

Subsequently, on 10 - 12 June, the SFE and thesis defences of students of the follow-up Master's degree programmes Fishery and Protection of Waters and Fishery and Protection of Waters took place. 16 students successfully completed the SFE in the study programme Fishery and Protection of Waters and 1 student successfully defended his/her diploma thesis in the study programme Fishery and Protection of Waters.

We would like to congratulate all successful graduates and wish them every success in their further studies and personal life.

Applications for the Bachelor's degree programmes in Protection of Waters and Fishery (taught only in Czech) can be submitted until 1 August 2024. More information can be found here.

On 28 March 2025, the Dean of the Faculty of Fisheries and Protection of Waters, Prof. Tomáš Policar, handed over certificates and contracts to the principal investigators of the winning projects, which are to contribute to the promotion of the sustainability of fisheries and the protection of nature, landscape and water.

Winning projects:

• Jakub Kocour - Know your enemy or how eDNA helps to protect native crayfish species
• Abdul Baten - Improving children's nutrition or more unhealthy fish products? Evaluating school canteen fish dishes in light of new legislation
• Tomáš Pěnka - Innovative use of aquaculture waste sludge: insect farming as fish feed
• Barbora Zdvihalová - Improvement of technology for nitrogen removal from wastewater: verification of the efficiency of a specific microbial consortium for nitrification and denitrification

The projects were ranked in the following order.

During the meeting, students presented the main focus and objectives of their projects. Each project will produce technical and promotional materials in the form of short videos or a leaflet and a final report.

Financial support for the student projects was provided by ČSOB, a.s. and students can start drawing it from 1 April 2025.